Zambrano Silva Samuel Professore AssociatoMedicina02/D1

TITOLI DI STUDIO

2003: Laurea in fisica, Università Complutense, Madrid (Spagna)

2006: Master in scienze della computazione e modellizzazione matematica, Università Rey Juan Carlos, Madrid (Spagna).

2007: Dottorato di ricerca in fisica, Università Rey Juan Carlos, Madrid (Spagna).

INCARICHI

2003-2017: Universidad Rey Juan Carlos, Madrid (Spagna).

Gruppo di Dinamica Non Lineare, Caos e Sistemi Complessi del Prof. Miguel A.F. Sanjuán.

• 2003-2007 Studente di dottorato.
• 2007-2009 Profesor ayudante doctor: ricercatore e docente (tempo determinato).
• 2009-2011 Profesor contratado doctor: ricercatore e docente (tempo indeterminato), in congedo tra il 2011 e il 2017.
• Ottobre 2017 – Settembre 2020: Ricercatore a tempo determinato senior.
• Ottobre 2020- oggi. Professore associato di fisica (SSD FIS/07).

2011-oggi: Università Vita-Salute San Raffaele e Ospedale San Raffaele.

Gruppo di Trascrizione e Cromatina in Cellule vive della Dssa. Alessandra Agresti, nell’Unità Dinamica della Cromatina del Prof. Marco E. Bianchi.

• Marzo 2011 – Marzo 2012: Postdoc selezionato nel primo “San Raffaele International Postdoctoral Programme”.
• Marzo 2012 – Marzo 2014: Borsista Marie Curie.
• Marzo 2014 – Marzo 2017: Postdoc.
• Aprile 2017 – Ottobre 2017: Assegnista di ricerca.
• Ottobre 2017 – ottobre 2020: Ricercatore a tempo determinato senior.

RICERCA

Mi sono formato nell’ambito della dinamica non lineare e del caos, specializzandomi nel controllo del caos e nell’analisi di serie temporali. Dal mio arrivo al San Raffaele mi sono focalizzato sulle applicazioni di queste idee nella biologia quantitativa e dei sistemi. In particolare mi sono dedicato alla dinamica del fattore di trascrizione NF-kB in singole cellule e al suo ruolo nel controllo della trascrizione.

FINANZIAMENTI

- PI per un assegno di ricerca finanziato dall’ateneo Università Vita-Salute San Raffaele. Titolo: “Characterization of nuclear dynamics and physical properties in myogenesis by live-cell imaging”. Da Gennaio 2021.

– PI del Seed Grant OSR.  Titolo: “Spatiotemporal dynamics of inflammation: role of NF-kB dynamics at a tissue level”. Da Gennaio 2018 a Gennaio 2019.

– Partecipazione come postdoc senior in un progetto finanziato nel bando 2016 dell’AIRC (Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro). Titolo: “NF-kB in motion: role of NF-kB dynamics in Multiple Myeloma and stromal cells interactions”. PI: Alessandra Agresti. Da Gennaio 2017.

– Marie Curie Intra-European Fellowship (IEF) per una borsa postdoc all’Università Vita-Salute San Raffaele:”Role of Nonlinear Dynamics of NF-kB in Inflammation” (2012).

–  Partecipazione a progetti di ricerca in Spagna: due progetti spagnoli (BFM2003-03081 e FIS2006-08525) uno europeo (HI03-207) e due co-finanziati della regione di Madrid e Universidad Rey Juan Carlos (URJC-CM-2006-CET-0643 and URJC-CM-2007-CET-1601).

PARTECIPAZIONE AD ASSOCIAZIONI PROFESSIONALI

Socio della Società Italiana di Biofisica e Biologia Molecolare (SIBBM) dal 2016, dell’Associazione della Biologia Cellulare e del Differenziamento (ABCD) e della Società Italiana di Caos e Complessità dal 2019.

ATTIVITÀ DIDATTICA

2006-2011: UNIVERSIDAD REY JUAN CARLOS, MADRID (SPAGNA)

Coordinatore e docente in diversi corsi di Fisica per le lauree in ingegneria e per la laurea di scienze ambientali dell’università. Docente dei corsi di dottorato nell’ambito della dinamica non lineare e dei sistemi complessi.

2011-oggi: UNIVERSITÀ VITA-SALUTE SAN RAFFAELE, MILANO (ITALIA)

2014/2015 – oggi: Docente e dal 2018 Coordinatore, Medical Physics. International MD program.

2018/2017 – oggi. Coordinatore, Elementi di Statistica e Fisica. Laurea in Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche.

2016/2017 – 2017/2018. Coordinatore, Fisica. Laurea in Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche.

2013/2014 – oggi: Docente, Espressione Genica in 4D. Laurea triennale in Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche.

2013/2014 – oggi: Tutor, Biologia cellulare e molecolare. Laurea in Medicina e Chirurgia e International MD program.

2014/2015 – oggi: Docente, Medical Physics. International MD program.

2015/2016 – oggi: Docente, Genetica e Biologia dello sviluppo. Laurea in Medicina e Chirurgia.

2016/2017 – oggi. Coordinatore, Fisica. Laurea in Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche.

Pubblicazioni selezionate/ Selected publications:

Samuel Zambrano, A. Loffreda, E. Carelli, G. Stefanelli, F. Colombo, E. Bertrand, A. Agresti, M. E. Bianchi N. Molina, D. Mazza. “First Responders Shape a Prompt and Sharp NF-κB-Mediated Transcriptional Response to TNF-α”. iScience 23(9), 101529 (2020).

G. Careccia, F. Colombo, M. Tirone, A. Agresti, M. E. Bianchi, Samuel Zambrano, E. Vénéreau. “Exploiting Live Imaging to Track Nuclei During Myoblast Differentiation and Fusion”. J. Vis. Exp. (146), e58888, (2019).

F. Colombo, Samuel Zambrano*, A. Agresti. “NF-kB, the importance of being dynamic: role and insights in cancer”. Biomedicines, 6 (2), 45 (2018).

E. Ramos-Marquès, Samuel Zambrano, A. Tiérrez, M. E. Bianchi, A. Agresti and F. García-del Portillo. “Single-cell analyses reveal an attenuated NF-kB response in the Salmonella-infected fibroblast”. Virulence 8:6, 719-740 (2017).

Samuel Zambrano, I. De Toma, A. Piffer, M. E. Bianchi and A. Agresti. “NF-kB oscillations translate into functionally related patterns of gene expression”. eLife 5:e09100 (2016).

R. Meucci, S. Euzzor, E. Pugliese, Samuel Zambrano, M.R. Gallas and J.A.C. Gallas. “Optimal Phase-Control Strategy for Damped-Driven Duffing Oscillators”. Phys. Rev. Lett. 116, 044101 (2016).

Samuel Zambrano, Marco E. Bianchi, Alessandra Agresti and Nacho Molina. “Interplay between stochasticity and negative feedback leads to pulsed dynamics and distinct gene activity patterns”. Phys. Rev. E 92, 02271 (2015).

Samuel Zambrano, M. E. Bianchi, A. Agresti. “A simple model of NF-kB dynamics reproduces experimental observations” Journal of Theoretical Biology, 347(21) 44-53 (2014).

Samuel Zambrano, M. E. Bianchi, A. Agresti. “High-Throughput Analysis of NF-kB Dynamics in Single Cells Reveals Basal Nuclear Localization of NF-kB and Spontaneous Activation of Oscillations”. PLoS ONE 9(3): e90104(2014).

J. Sabuco, Samuel Zambrano, M. A. F. Sanjuán, and James A. Yorke. “Finding safety in partially controllable chaotic systems”. Commun. Nonlinear Sci. Numer. Simulat., 17:4274-4280 (2012).

Samuel Zambrano, I. P. Mariño, J. M. Seoane, M. A. F. Sanjuán, S. Euzzor, A. Geltrude, R. Meucci and F. T. Arecchi, “Synchronization of uncoupled excitable systems induced by white and coloured noise”. New Journal of Physics, 12 053040 (2010).

Samuel Zambrano, M. A. F. Sanjuán and J. A. Yorke, “Partial Control of Chaotic Systems”. Phys. Rev. E 77, 055201(R) (2008).

J. M. Amigó, Samuel Zambrano and M. A. F. Sanjuán. “True and false forbidden patterns in deterministic and random dynamics”, Europhys. Lett. 79, 50001 (2007).