Dottorato di Ricerca Internazionale in Medicina Molecolare
Offerta formativa
Il nostro corso di Dottorato in Medicina Molecolare ha lo scopo di fornire un’eccellente formazione interdisciplinare nell’ambito della Medicina Molecolare.
La/il dottoranda/o lavorerà sul progetto di ricerca con la supervisione del proprio Director of Studies e la consulenza scientifica di una/un seconda/o supervisor esterna/o.
L’attività didattica offerta è interamente in lingua inglese e copre l’intera durata del Corso.
Ogni anno il Corso di Dottorato in Medicina Molecolare offre un insieme di corsi che approfondiscono le più interessanti aree di ricerca di ciascun curriculum e forniscono alle studentesse e agli studenti la formazione indispensabile per una carriera di successo nel mondo accademico.
L’attività didattica offerta è interamente in lingua inglese.
È previsto che le studentesse e gli studenti svolgano un ruolo fondamentale nella vita della nostra comunità scientifica, partecipando a lezioni, workshop e seminari organizzati dall’Istituto Scientifico San Raffaele.
Le dottorande e i dottorandi, inoltre, possono essere coinvolte/i nell’insegnamento e nelle attività di tutorato rivolte alle studentesse e agli studenti dei corsi di Laurea UniSR.
Offerta formativa a.a. 2026/2027
Di seguito l'offerta formativa approvata per l'a.a. 2026/2027
Communicating research: Short oral presentation
IT Course
Research Integrity
Gender Equality
Statistical methods in R
Curriculum specific courses
PhD interdisciplinary seminars
PhD Invited Lectures
Career opportunities seminar series
Diving into the data management plan (DMP) and IRIS
Pills of Bioinformatics
Communicating research: Writing a paper + The editorial process
Curriculum specific courses
Gender Medicine
Scientific Pubblishing
Writing Successful Fellowship
Open science in practice
Statistical methods in biomedical research
Statistical Methods in R
Application of statistical analyses to basic research use cases
Application of statistical analyses to clinical use cases
Foundamentals of AI in medicine
PhD interdisciplinary seminars
PhD Invited Lectures
Career opportunities seminar series
Pills of Bioinformatics
How to review a scientific papers
Science Communication
The european research framework: policy, funding programmes and research management
Statistical methods in biomedical research
Statistical Methods in R
Application of statistical analyses to basic research use cases
Application of statistical analyses to clinical use cases
Foundamentals of AI in medicine
PhD interdisciplinary seminars
PhD Invited Lectures
Career opportunities seminar series
Pills of Bioinformatics
Explotation of Research Results and Intellectual Property
Attività didattica a.a. 2025/2026
Di seguito è riportato il programma formativo previsto per l'a.a. 2025/2026
The role of glial cells in neurodegeneration (NEN)
Questo corso esplora il ruolo fondamentale delle cellule gliali nel mantenimento della salute del cervello. Verranno esaminate le alterazioni delle cellule gliali con l’invecchiamento, il loro contributo all’infiammazione cerebrale e come questi cambiamenti siano collegati ai processi neurodegenerativi. Gli studenti si confronteranno con le ricerche più recenti e strategie innovative per modulare l’attività delle cellule gliali, al fine di rallentare la progressione delle malattie e migliorare la neuroprotezione. Le lezioni includeranno anche diversi modelli sperimentali, tra cui sistemi di pesci, topi e umani, per illustrare i diversi meccanismi di funzionamento delle cellule gliali e le loro implicazioni terapeutiche. Alla fine del corso, gli studenti avranno una comprensione approfondita degli sviluppi contemporanei nella biologia gliale e saranno in grado di esplorare nuovi approcci per affrontare le malattie neurodegenerative.
The revolution of immunotherapy (ECM)
Questo seminario si concentra sulle applicazioni attuali e sugli ultimi sviluppi in laboratorio. L’immunoterapia ha rappresentato una svolta nel trattamento delle principali malattie oncologiche e non solo. Il seminario esplorerà il campo dell’oncologia, sia dal punto di vista biologico sia per la sua applicazione attuale come strumento terapeutico. Verranno anche affrontate le sfide future e il trattamento degli effetti collaterali. Il seminario avrà un approccio traslazionale, includendo importanti ricercatori sia all’interno del nostro Istituto sia dall’esterno, permettendo discussioni fruttuose.
Fibroblastic Reticular Cells: Regulators of Immunity in Physiology and Cancer (BAIO)
Le Fibroblastic reticular cells (FRCs) nei tessuti linfoidi, come i linfonodi, si sono rivelate attori cruciali nell’induzione e nella regolazione sia dell’immunità innata sia di quella adattativa. Questo corso fornirà una panoramica delle conoscenze più aggiornate sull’origine e la differenziazione delle FRC, nonché sui meccanismi attraverso i quali le FRC supportano l’organizzazione e la funzione delle cellule immunitarie sia in condizioni fisiologiche sia nel cancro.
Organ regeneration: models and mechanisms (GCT and CMB)
Il corso esplorerà i principali argomenti legati alla rigenerazione dei tessuti, comprendendo concetti fondamentali, meccanismi molecolari e gli ultimi progressi nel campo. Verranno considerati diversi organismi modello, dai rettili, pesci e nematodi ai mammiferi come roditori e umani, e saranno trattati vari tipi di tessuti, tra cui epiteliale (cute, fegato), muscolare e nervoso.
Communicating research: Short oral presentation - Embo Solutions
Durante questo workshop, gli editor di EMBO Press lavoreranno con gli studenti di dottorato sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Il workshop si concentrerà su come presentare efficacemente il proprio lavoro in forma orale breve in diversi contesti – ad esempio poster, flash talk o elevator pitch. Il corso include una combinazione equilibrata di presentazione teorica, lavoro di gruppo e discussioni interattive per mantenere gli studenti coinvolti.
IT course - UniSR IT Team
Il corso mira a fornire agli studenti di dottorato conoscenze metodologiche e tecnologiche sull’uso degli strumenti relativi all’automazione d’ufficio, networking, cloud e cyber security. Il corso tratterà i seguenti argomenti: utilizzo base e avanzato di Microsoft Excel, utilizzo avanzato di Microsoft Word, protocolli di comunicazione e protocolli di sicurezza, elementi base di sicurezza informatica, protezione dei dati e tecniche avanzate di cyber security.
Research Integrity - Roberto Buccione and Elena Criscuolo
Il seminario Research Integrity – General Principles fornisce una panoramica dei principi fondamentali dell’integrità della ricerca, della definizione di cattiva condotta scientifica e pratiche di ricerca discutibili, consigli generali su come affrontare le problematiche complesse che possono emergere nella pianificazione, conduzione e comunicazione della ricerca, e sulle funzioni e il campo di azione dell’Research Integrity Office.
Gender Equality - Simone Mattavelli and Monica Fabbri
Nonostante i significativi progressi sociali degli ultimi decenni e l’introduzione di interventi politici mirati, persiste uno squilibrio tra uomini e donne nelle società occidentali moderne. Le conseguenze di questo fenomeno, noto come gender bias, sono state studiate a diversi livelli. Ad esempio, le donne sono sotto-rappresentate nelle posizioni di leadership più elevate e numerosi studi hanno dimostrato che il gender bias nelle discipline scientifiche e in medicina è ancora oggi persistente. Inoltre, il gender bias può manifestarsi in modi diversi, da forme più evidenti a manifestazioni più sottili, come le espressioni linguistiche adottate nelle interazioni quotidiane. La ricerca in cognizione sociale ha mostrato che le radici del gender bias devono essere ricercate nel concetto di stereotype. Gli stereotypes non sono altro che etichette che gli esseri umani tendono ad associare a entità e categorie sociali, influenzando il modo in cui pensiamo e ci comportiamo. Seguendo un approccio socio-cognitivo, questo corso mira a fornire una migliore comprensione del gender bias conoscendo (i) cosa sono i gender-stereotypes; (ii) come si formano e vengono alimentati dalla società; (iii) quali sono le loro conseguenze; e (iv) quali interventi possono contribuire a smantellarli. Infine, il corso includerà un’analisi approfondita dedicata al "Gender Equality Plan" approvato da UniSR.
Statistical methods in R - Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L’obiettivo è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni affrontati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un’introduzione di base a R, trattando la gestione dei dati, la modellazione statistica e la visualizzazione dei dati. Saranno introdotti elementi di scripting. Il corso avrà un’impostazione pratica e interattiva, con l’apprendimento principalmente tramite la presentazione di problemi reali e le relative soluzioni attraverso attività hands-on.
Problem Solving Logics - Enrico Dalla Rosa
Il focus di questa lezione è l’errore umano. La nostra specie ha avuto successo nella “lotteria dell’evoluzione”, grazie anche a una buona capacità di evitare – complessivamente – errori fatali. Tuttavia, la crescente complessità del mondo rende sempre più importante evitare errori che possano avere conseguenze gravi, particolarmente in alcuni ambiti – la medicina è uno di questi.
Sebbene ci piaccia pensare che, di fronte a situazioni complesse, siamo sostanzialmente razionali, è facile dimostrare che la maggior parte delle persone – anche quelle con un QI molto alto – può commettere errori rilevanti in modo prevedibile. Durante il ciclo di lezioni, cercheremo di “vaccinarci” contro alcuni dei bias prevedibili che ci spingono a commettere errori anche quando cerchiamo di evitarli con la massima attenzione.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un’impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati significativi e supportare i ricercatori in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Pro-Rettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme all’Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall’impatto sociale della scienza a come gestire carichi di lavoro ad alta pressione.
L’obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso comprenderà 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di studenti di dottorato dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO) e PhD Office.
Diving into the data management plan (DMP) and IRIS - Silvia Corbetta and Marco Soriano
Questo corso discuterà due strumenti essenziali per la ricerca. La prima parte si concentrerà sul DMP, cioè un documento strutturato che delinea tutti gli aspetti del ciclo di vita dei dati di ricerca (ad es. organizzazione e cura dei dati, disposizioni adeguate per la loro conservazione e condivisione). Redigere un DMP permette di affrontare in anticipo tutte le necessità e le sfide che potrebbero emergere durante un progetto di ricerca ed è considerata una best practice, poiché rende il lavoro più efficiente e contribuisce alla conservazione a lungo termine dei dati. Dopo aver introdotto le componenti tipiche di un DMP, saranno fornite informazioni pratiche su come affrontarle. Inoltre, tramite la sessione di Q&A, gli studenti avranno la possibilità di discutere le sfide che stanno affrontando e chiarire eventuali dubbi sul loro DMP.
La seconda parte del corso si concentrerà su UniSR IRIS. Dopo aver introdotto i concetti e i principi fondamentali dell’Open Access alle pubblicazioni, saranno fornite informazioni pratiche su come utilizzare IRIS per depositare, raccogliere e diffondere le pubblicazioni.
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un Comitato di Studenti di Dottorato, composto da studenti di diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono lezioni aperte a tutti i membri dell’istituto e dedicano poi una parte consistente del tempo a discutere con gli studenti di dottorato sia della loro ricerca sia di temi più generali, come il percorso per diventare ricercatori indipendenti. Le PhD student-invited lectures offrono agli studenti l’opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un contesto informale e di migliorare le proprie competenze di networking, cruciali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per gli studenti di dottorato nei campi della ricerca e settori correlati, sia pubblici sia privati. La vasta gamma di percorsi professionali a cui gli studenti di dottorato possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili. Per favorire questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati diversi seminari da professionisti di spicco in diversi settori di interesse, provenienti sia dal mondo accademico sia da quello aziendale. I seminari includono generalmente una breve panoramica del percorso professionale del relatore fino alla posizione attuale, una descrizione delle sue attività e infine una fase di colloqui individuali o di gruppo con gli studenti di dottorato.
The role of glial cells in neurodegeneration (NEN)
Questo corso esplora il ruolo fondamentale delle cellule gliali nel mantenimento della salute cerebrale. Verranno esaminate le alterazioni delle cellule gliali con l’invecchiamento, il loro contributo all’infiammazione cerebrale e come tali cambiamenti siano collegati ai processi neurodegenerativi. Gli studenti si confronteranno con le ricerche più recenti e con strategie innovative per modulare l’attività delle cellule gliali, al fine di rallentare la progressione delle malattie e migliorare la neuroprotezione. Le lezioni includeranno anche vari modelli sperimentali, tra cui sistemi di pesci, topi e umani, per illustrare i diversi meccanismi di funzionamento delle cellule gliali e le loro implicazioni terapeutiche. Al termine del corso, gli studenti avranno una comprensione approfondita degli sviluppi contemporanei nella biologia gliale e saranno in grado di esplorare nuovi approcci per affrontare le malattie neurodegenerative.
The revolution of immunotherapy (ECM)
Questo seminario si concentra sulle applicazioni attuali e sugli ultimi sviluppi in laboratorio. L’immunoterapia ha rappresentato una svolta nel trattamento delle principali malattie oncologiche e oltre. Il seminario esplorerà il campo dell’oncologia sia dal punto di vista biologico sia per la sua applicazione come strumento terapeutico. Verranno affrontate anche le sfide future e il trattamento degli effetti collaterali. Il seminario avrà un approccio traslazionale, includendo importanti ricercatori sia all’interno del nostro Istituto sia dall’esterno, permettendo una discussione fruttuosa.
Fibroblastic Reticular Cells: Regulators of Immunity in Physiology and Cancer (BAIO)
Le Fibroblastic reticular cells (FRCs) nei tessuti linfoidi, come i linfonodi, si sono rivelate attori cruciali nell’induzione e nella regolazione sia dell’immunità innata sia di quella adattativa. Questo corso fornirà una panoramica delle conoscenze più aggiornate sull’origine e la differenziazione delle FRC, nonché sui meccanismi attraverso cui le FRC supportano l’organizzazione e la funzione delle cellule immunitarie sia in condizioni fisiologiche sia nel cancro.
Organ regeneration: models and mechanisms (GCT and CMB)
Il corso esplorerà i principali argomenti legati alla rigenerazione dei tessuti, comprendendo concetti fondamentali, meccanismi molecolari e gli ultimi progressi nel campo. Verranno considerati diversi organismi modello, dai rettili, pesci e nematodi ai mammiferi come roditori e umani, e saranno trattati vari tipi di tessuti, tra cui epiteliale (cute, fegato), muscolare e nervoso.
Communicating research: Writing a paper - The editorial process - Embo Solutions
In questo workshop, gli editor di EMBO Press lavorano con studenti di dottorato o postdoc sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Gli argomenti trattati includono la comprensione della struttura e del contenuto di un manoscritto, la composizione delle figure e la scrittura di titoli e abstract efficaci. I partecipanti impareranno anche a muoversi nel processo editoriale delle riviste. Il corso include una combinazione equilibrata di presentazione teorica, lavoro di gruppo e discussioni interattive per mantenere gli studenti coinvolti.
Scientific Publishing - Roberto Buccione
Il corso parte dal presupposto che l’impatto delle scoperte scientifiche sarebbe molto limitato senza la comunicazione dei risultati ai pari. Questa comunicazione può assumere molte forme, ma tipicamente avviene tramite pubblicazioni accademiche peer-reviewed. Verranno discussi i meccanismi base del peer-review, il processo editoriale nelle riviste scientifiche, nonché informazioni sulla corretta attribuzione della paternità dei lavori, secondo le regole accettate dalla comunità, e sulla divisione di responsabilità e diritti associati alla paternità.
Gender Medicine - Alaide Chieffo and Andrea Salonia
Storicamente, medicina e biologia sono state sviluppate con un approccio androcentrico, generalizzando i risultati alle donne e limitando le differenze di sesso solo alle questioni riproduttive. Il corso Gender Medicine fornirà un’introduzione alla medicina di nuova generazione, spiegherà definizioni, evidenzierà riferimenti normativi e risorse, e discuterà esempi e implicazioni per la ricerca e i servizi sanitari.
Writing Successful Fellowship Applications - Thiago Carvalho and David del Álamo (Fellowsherpa)
Per molti ricercatori alle prime armi, scrivere una domanda di fellowship rappresenterà la loro prima esperienza con il sistema altamente competitivo dei finanziamenti scientifici. Il corso interattivo di due giorni di Fellowsherpa espone i partecipanti ad alcune delle fellowship internazionali più prestigiose, tra cui i programmi post-dottorato Marie Skłodowska-Curie, EMBO e Human Frontier Science Program.
Statistical methods in biomedical research - Paola Rancoita and Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti base e avanzati per la raccolta, l’organizzazione e l’analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è diviso in due moduli:
MODULE 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULE 2: Modellizzazione delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli non dipende dall’anno di iscrizione, ma dalle competenze possedute.
Statistical methods in R - Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L’obiettivo è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni affrontati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un’introduzione di base a R, includendo gestione dei dati, modellizzazione statistica e visualizzazione dei dati. Saranno introdotti elementi di scripting. Il corso avrà un’impostazione pratica e interattiva, con apprendimento principalmente tramite la presentazione di problemi reali e le relative soluzioni hands-on.
Business Planning - Giancarlo Monza
La ricerca e sviluppo (R&D) di oggi rappresenta la pratica medica di domani. Purtroppo, la sostenibilità della R&D è a rischio. Altri settori altamente innovativi (es. industria aerospaziale, IT e anche l’esercito) hanno cercato di affrontare la sostenibilità migliorando le capacità di pianificazione ed esecuzione dei progetti e l’attenzione ai fattori umani.
Durante le conversazioni verranno riviste le tecniche base di pianificazione dei progetti e performance del team (=persone) per minimizzare/prevenire errori umani, con focus sulle peculiarità della R&D in ambito sanitario, dove etica e approcci centrati sul paziente sono fondamentali. Verranno presentati esempi pratici di progetti falliti e completati con successo in ambito sanitario.
Fundamentals of AI in medicine - Carlo Tacchetti - Patrick Scuri - Andrea Corvaglia - Alberto Traverso
L’Intelligenza Artificiale (AI) sta guadagnando sempre più popolarità in ambito sanitario. Tecnologie che permettono l’automazione di attività cliniche lunghe o sistemi di supporto decisionale clinico basati sul machine learning (ML), una branca dell’AI, possono migliorare la cura del cancro. Tuttavia, l’uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati fuori dal contesto clinico senza coinvolgere i professionisti sanitari, riduce l’impatto clinico e genera sfiducia nell’AI. Verranno introdotte ai giovani ricercatori clinici le basi dell’AI, con panoramica dei principali algoritmi di ML e applicazioni ai dati sanitari, progettazione di studi clinici per lo sviluppo di algoritmi AI, e questioni etiche e di privacy legate all’uso di algoritmi AI in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un’impresa complessa che richiede conoscenze ampie al di fuori del contesto specifico per produrre risultati significativi e aiutare i ricercatori a prosperare in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Pro-Rettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme all’Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall’impatto sociale della scienza alla gestione di carichi di lavoro ad alta pressione.
L’obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso comprenderà 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di studenti di dottorato dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO) e l'ufficio dottorati
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un Comitato di Studenti di Dottorato, composto da studenti di diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono lezioni aperte a tutti i membri dell’istituto e dedicano poi una parte consistente del tempo a discutere con gli studenti di dottorato sia della loro ricerca sia di temi più generali, come il percorso per diventare ricercatori indipendenti. Le PhD student-invited lectures offrono agli studenti l’opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un contesto informale e di migliorare le proprie competenze di networking, cruciali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per gli studenti di dottorato nei campi della ricerca e settori correlati, sia pubblici sia privati. La vasta gamma di percorsi professionali a cui gli studenti di dottorato possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili. Per favorire questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati diversi seminari da professionisti di spicco provenienti sia dal mondo accademico sia da quello aziendale. I seminari includono generalmente una panoramica del percorso professionale del relatore fino alla posizione attuale, una descrizione delle sue attività e infine una fase di colloqui individuali o di gruppo con gli studenti di dottorato.
Application of statistical analyses to basic research use cases - Giovanni Tonon
Durante questo tutorial di 2 ore verranno presentate domande derivanti dalla pratica quotidiana della ricerca, e gli studenti saranno guidati attraverso gli strumenti statistici e gli approcci più appropriati per affrontarle. Verrà utilizzato il software GraphPad Prism e gli studenti riceveranno formazione pratica sul suo utilizzo.
Application of statistical analyses to clinical research use cases - Chiara Brombin
Il tutorial illustrerà le principali funzioni e procedure del software IBM SPSS per l’analisi di dati comunemente raccolti nella pratica clinica. L’attività sarà condotta con un approccio applicato, volto a sviluppare competenze pratiche nell’utilizzo del software, finalizzate a rispondere a specifiche domande di ricerca.
Open Science in practice - Silvia Corbetta - Maya Fedeli - Marco Soriano - Marco Morelli
L’approccio di Open Science comprende tutte le pratiche che promuovono accessibilità e trasparenza a tutti i livelli del ciclo di vita della ricerca, per garantire la riproducibilità e l’utilità sociale della ricerca scientifica. Il corso sarà diviso in due sessioni. Una sessione si concentrerà sui principi fondamentali dell’approccio Open Science, fornendo informazioni pratiche, linee guida e strumenti su come rendere aperte le pubblicazioni scientifiche (e altri output di ricerca), nonché su come adottare metodologie come la Citizen Science, volte a favorire la collaborazione tra comunità scientifica e società. L’altra sessione si concentrerà sul feedback riguardo ai Data Management Plans (DMP) precedentemente inviati dagli studenti, affrontando gli aspetti meno chiari della gestione responsabile e della condivisione dei dati di ricerca.
The role of glial cells in neurodegeneration (NEN)
Questo corso esplora il ruolo fondamentale delle cellule gliali nel mantenimento della salute cerebrale. Verranno esaminate le alterazioni delle cellule gliali con l’invecchiamento, il loro contributo all’infiammazione cerebrale e come questi cambiamenti siano collegati ai processi neurodegenerativi. Gli studenti si confronteranno con ricerche recenti e strategie innovative per modulare l’attività delle cellule gliali, al fine di rallentare la progressione della malattia e migliorare la neuroprotezione. Le lezioni includeranno vari modelli sperimentali, tra cui sistemi di pesci, topi e umani, per illustrare i diversi meccanismi di funzionamento delle cellule gliali e le loro implicazioni terapeutiche. Al termine del corso, gli studenti avranno una comprensione approfondita degli sviluppi contemporanei nella biologia gliale e saranno in grado di esplorare nuovi approcci per affrontare le malattie neurodegenerative.
The revolution of immunotherapy (ECM)
Questo seminario si concentra sulle applicazioni attuali e sugli ultimi sviluppi in laboratorio. L’immunoterapia ha rappresentato una svolta nel trattamento delle principali malattie oncologiche e oltre. Il seminario esplorerà il campo dell’oncologia sia dal punto di vista biologico sia per la sua applicazione come strumento terapeutico. Verranno trattate anche le sfide future e il trattamento degli effetti collaterali. Il seminario avrà un approccio traslazionale, includendo importanti ricercatori sia all’interno del nostro Istituto sia dall’esterno, permettendo una discussione fruttuosa.
Fibroblastic Reticular Cells: Regulators of Immunity in Physiology and Cancer (BAIO)
Le Fibroblastic reticular cells (FRCs) nei tessuti linfoidi, come i linfonodi, si sono rivelate attori cruciali nell’induzione e nella regolazione sia dell’immunità innata sia di quella adattativa. Questo corso fornirà una panoramica delle conoscenze più aggiornate sull’origine e la differenziazione delle FRC, nonché sui meccanismi attraverso cui le FRC supportano l’organizzazione e la funzione delle cellule immunitarie sia in condizioni fisiologiche sia nel cancro.
Organ regeneration: models and mechanisms (GCT and CMB)
Il corso esplorerà i principali argomenti legati alla rigenerazione dei tessuti, comprendendo concetti fondamentali, meccanismi molecolari e gli ultimi progressi nel campo. Verranno considerati diversi organismi modello, dai rettili, pesci e nematodi ai mammiferi come roditori e umani, e saranno trattati vari tipi di tessuti, tra cui epiteliale (cute, fegato), muscolare e nervoso.
How to review scientific papers - Embo Solutions
In questo workshop, gli editor di EMBO Press lavorano con gli studenti di dottorato sui principi e sulle pratiche della peer review. Gli argomenti trattati includono gli elementi chiave di una buona peer review e il ruolo della peer review nella pubblicazione di scienza riproducibile. Verranno inoltre discussi aspetti etici come i conflitti di interesse e fornite linee guida ai giovani scienziati su come diventare buoni revisori. Il corso include una combinazione equilibrata di presentazione teorica, lavoro di gruppo e discussioni interattive per mantenere gli studenti coinvolti.
Science Communication - Maya Fedeli
Il corso Science Communication è progettato per sviluppare le competenze comunicative degli studenti di dottorato, permettendo loro di trasmettere concetti scientifici complessi a un pubblico più ampio in maniera chiara, coinvolgente e accessibile. Durante il corso, gli studenti acquisiranno conoscenze sulle strategie di comunicazione scientifica, impareranno a tradurre il linguaggio tecnico in un formato comprensibile dal pubblico generale e miglioreranno le proprie abilità nell’uso di diverse piattaforme e strumenti di comunicazione. Dopo un’introduzione ai fondamenti della comunicazione scientifica, saranno trattati argomenti quali tecniche di scrittura e uso di un linguaggio chiaro e accessibile, sviluppo delle capacità di presentazione, comunicazione visiva e uso corretto ed efficace dei media e dei social media.
Open Science in practice: principles and tools for open access to scientific publications and research data - Silvia Corbetta - Marco Soriano
L’approccio Open Science comprende tutte le pratiche che promuovono accessibilità e trasparenza a tutti i livelli del ciclo di vita della ricerca. Questo corso introdurrà i concetti e i principi fondamentali dell’Open Science (ad es., open access, condivisione dei dati) e fornirà linee guida e strumenti su come rendere aperte le pubblicazioni scientifiche e i dati di ricerca, garantendo riproducibilità e utilità sociale della ricerca. Verranno inoltre fornite informazioni pratiche su come utilizzare i repository istituzionali per pubblicazioni (IRIS) e dati (ORDR).
Statistical methods in biomedical research - Paola Rancoita and Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti base e avanzati per la raccolta, l’organizzazione e l’analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è diviso in due moduli:
MODULE 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULE 2: Modellizzazione delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli non dipende dall’anno di iscrizione, ma dalle competenze possedute.
Statistical methods in R - Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L’obiettivo è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni affrontati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un’introduzione di base a R, includendo gestione dei dati, modellizzazione statistica e visualizzazione dei dati. Saranno introdotti elementi di scripting. Il corso avrà un’impostazione pratica e interattiva, con apprendimento principalmente tramite la presentazione di problemi reali e le relative soluzioni hands-on.
Project Assessment - Gianni Navalesi
E cosa succede se il mio progetto scientifico/clinico non procede come previsto? Dobbiamo cercare altre opportunità o abbandonare quanto fatto? Ci concentreremo sull’importanza di avere a disposizione tecniche di approccio basate sul rischio, pianificazione del rischio e misure di minimizzazione del rischio. Questi strumenti sono finalizzati a mitigare eventuali deviazioni indesiderate dagli obiettivi scientifici.
In questo contesto, verrà sottolineata l’importanza di avere in mente soluzioni alternative nel caso in cui l’obiettivo principale non possa essere raggiunto. Verranno discussi esempi di farmaci riutilizzati da un’indicazione clinica a un’altra (es. Sildenafil), nonché la possibilità di passare ad altri settori come Medical Devices o Food supplement.
Fundamentals of AI in medicine - Carlo tacchetti - Patrick Scuri - Andrea Corvaglia - Alberto Traverso
L’Intelligenza Artificiale (AI) sta guadagnando sempre più popolarità in ambito sanitario. Tecnologie che permettono l’automazione di attività cliniche lunghe o sistemi di supporto decisionale clinico basati sul machine learning (ML), una branca dell’AI, possono migliorare la cura del cancro. Tuttavia, l’uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati al di fuori del contesto clinico senza coinvolgere i professionisti sanitari, riduce l’impatto clinico e genera sfiducia nell’AI. Verranno introdotte ai giovani ricercatori clinici le basi dell’AI, con panoramica dei principali algoritmi di ML e applicazioni ai dati sanitari, progettazione di studi clinici per lo sviluppo di algoritmi AI, e questioni etiche e di privacy legate all’uso di algoritmi AI in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un’impresa complessa che richiede conoscenze ampie al di fuori del contesto specifico per produrre risultati significativi e aiutare i ricercatori a prosperare in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Pro-Rettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme all’Research Policy Office (RPO) e all'ufficio dottorati per discutere temi interdisciplinari, dall’impatto sociale della scienza alla gestione di carichi di lavoro ad alta pressione.
L’obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso comprenderà 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di studenti di dottorato dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO) e l'ufficio dottorati
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un Comitato di Studenti di Dottorato, composto da studenti di diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono lezioni aperte a tutti i membri dell’istituto e dedicano poi una parte consistente del tempo a discutere con gli studenti di dottorato sia della loro ricerca sia di temi più generali, come il percorso per diventare ricercatori indipendenti. Le PhD student-invited lectures offrono agli studenti l’opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un contesto informale e di migliorare le proprie competenze di networking, cruciali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per gli studenti di dottorato nei campi della ricerca e settori correlati, sia pubblici sia privati. La vasta gamma di percorsi professionali a cui gli studenti di dottorato possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili. Per favorire questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati diversi seminari da professionisti di spicco provenienti sia dal mondo accademico sia da quello aziendale. I seminari includono generalmente una panoramica del percorso professionale del relatore fino alla posizione attuale, una descrizione delle sue attività e infine una fase di colloqui individuali o di gruppo con gli studenti di dottorato.
The european research framework: policy, funding programmes and research management - Federica Prete
Il Corso mira a comprendere il percorso che porta dall'argomento di un bando, passando per lo sviluppo di un'idea progettuale, fino alla stesura di una proposta alla sua presentazione nell'ambito di Horizon Europe e a fornire conoscenze e strumenti per lo sviluppo di progetti di ricerca europei. Inoltre, il corso presenterà le caratteristiche principali di Horizon Europe e i programmi ERC e Marie Curie.Infine, il corso introdurrà la Citizen Science e come integrare questo approccio innovativo nei progetti di ricerca.
Attività didattica a.a. 2024/2025
Di seguito è riportato il programma formativo previsto per l'a.a. 2024/2025
Courses curriculum-specific:
Current Mechanism Understanding and Treatment Development in Epilepsy (NEN)
L'epilessia è un disturbo altamente eterogeneo che colpisce oltre 50 milioni di persone in tutto il mondo. I pazienti epilettici sono caratterizzati da crisi ricorrenti, che possono variare ampiamente per tipo ed eziologia. Mentre alcuni casi sono chiaramente legati a fattori genetici, altri sono causati da condizioni acquisite come ictus, infezioni, lesioni cerebrali traumatiche o tumori, che possono interrompere i normali schemi di attività cerebrale e portare a crisi. È importante notare che un terzo dei pazienti non risponde ai trattamenti attuali. Questo corso di dottorato approfondirà i meccanismi fondamentali alla base sia dell'epilessia genetica (Dr. Ethan Goldberg, Children's Hospital of Philadelphia) che dell'epilessia acquisita (Dr. Christophe Bernard, Institute of Systems Neuroscience, Aix Marseille Université, Francia). Successivamente, esplorerà le alterazioni secondarie che si verificano nel cervello epilettico e discuterà il potenziale di mirare a queste modifiche per interventi terapeutici. (Dr. Anna Maria Vezzani, Mario Negri Institute for Pharmacological Research). Infine, il corso presenterà approcci terapeutici innovativi basati sulla terapia genica, adatti sia per le epilessie genetiche che acquisite (Prof. Gabriele Lignani, University College London). Tenuto da esperti di rilevo, questo corso offrirà ai partecipanti l'opportunità di approfondire la loro comprensione dell'epilessia e contribuire allo sviluppo di soluzioni innovative per identificare nuovi meccanismi e terapie. Le sessioni mattutine consisteranno in lezioni frontali. Nel pomeriggio del primo giorno, gli studenti saranno invitati a presentare articoli in formato Journal Club. Inoltre, saranno divisi in gruppi di lavoro e a ciascun gruppo verrà assegnata una domanda di ricerca specifica da sviluppare in un breve piano sperimentale. Nel pomeriggio del secondo giorno del corso, questi lavori saranno discussi insieme agli organizzatori e agli esperti. Completando questo corso, i partecipanti acquisiranno le seguenti competenze:
- Comprendere i meccanismi chiave alla base sia dell'epilessia genetica che acquisita
- Conoscere gli strumenti e i modelli di ricerca utilizzati nella ricerca sull'epilessia
- Identificare le sfide nello sviluppo di nuovi trattamenti e terapie per l'epilessia
Relatori: Prof. Michele Simonato, Università di Ferrara (Introduzione); Dr. Ethan Goldberg (Meccanismi alla base delle epilessie genetiche); Dr. Christophe Bernard (Meccanismi delle epilessie acquisite); Dr. Anna Maria Vezzani (Modificazioni secondarie nel cervello epilettico); Prof. Gabriele Lignani (Terapia genica nell'epilessia)
Innovative approaches to model and treat muscular and neuromuscular diseases (GCT)
Le malattie muscolari e neuromuscolari rappresentano un gruppo eterogeneo di disturbi con un significativo impatto medico e sociale. Le malattie neuromuscolari e muscolari condividono diverse caratteristiche chiave, in quanto entrambe interessano i componenti del sistema motorio responsabili dei movimenti, della respirazione, della postura e di altre funzioni fisiche. Entrambi i tipi di malattie spesso causano debolezza muscolare, atrofia o funzione compromessa, sia per danni diretti ai muscoli (come nelle malattie muscolari) sia per la distruzione dell'input neurale necessario per l'attivazione e il mantenimento dei muscoli (come nelle malattie neuromuscolari). Molte di queste condizioni hanno una base genetica, con mutazioni in proteine strutturali (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare) o in proteine necessarie per la trasmissione della giunzione neuromuscolare (ad esempio, i recettori dell'acetilcolina nella miastenia grave). Entrambe le categorie possono comportare una degenerazione progressiva, che porta a ridotta mobilità, affaticamento e una qualità della vita compromessa. Affrontare queste condizioni richiede un approccio multidisciplinare, combinando intuizioni dalla genetica, neurologia e medicina rigenerativa per sviluppare trattamenti efficaci.
Il trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari è stato rivoluzionato dall'introduzione di innovativi Prodotti Medicinali per Terapie Avanzate (ATMP), che includono cellule modificate geneticamente, vettori virali e strumenti molecolari innovativi. La terapia genica offre la possibilità di affrontare le cause alla base di queste malattie introducendo, riparando o silenziando sequenze genetiche specifiche. Gli approcci basati sulle cellule staminali permettono la sostituzione di cellule muscolari danneggiate o disfunzionali e forniscono piattaforme per la somministrazione sostenuta di proteine. Inoltre, la modellizzazione della malattia, utilizzando cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) derivate dai pazienti, organoidi o modelli di topo transgenici, è diventata fondamentale per comprendere i meccanismi molecolari alla base dei disturbi muscolari e neuromuscolari. Questi modelli ricapitolano la patologia della malattia, permettendo di testare strategie terapeutiche e identificare nuovi target azionabili. Queste modalità avanzate sono anche combinate con approcci di medicina di precisione per adattare i trattamenti ai profili genetici e fenotipici individuali dei pazienti. Queste terapie all'avanguardia rappresentano un cambiamento di paradigma nell'affrontare la patologia sottostante delle malattie muscolari e neuromuscolari, offrendo speranza per un'efficacia a lungo termine e un miglioramento degli esiti per i pazienti.
Tuttavia, nonostante i recenti progressi, gli ATMP mirati al trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari affrontano diverse sfide che limitano la loro efficacia attuale. La consegna efficiente rimane un ostacolo importante, poiché tessuti ampi come i muscoli scheletrici e il sistema nervoso periferico richiedono una distribuzione diffusa e mirata, spesso ostacolata da barriere come la barriera emato-neurale. Le risposte immunitarie ai vettori virali, così come la grande dimensione di alcuni geni terapeutici (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare di Duchenne), complicano ulteriormente il trattamento. La durata degli effetti terapeutici è anche una questione, poiché l'espressione del trasgene o l'innesto cellulare spesso diminuiscono nel tempo nell'ambiente tissutale malato. Inoltre, l'eterogeneità di queste malattie e la necessità di mirare a più tessuti, come il muscolo scheletrico e il cuore, complicano la progettazione della terapia. I modelli sperimentali attuali spesso non replicano le complessità delle malattie umane, limitando il successo predittivo, mentre l'infiammazione cronica e la fibrosi nei tessuti colpiti ostacolano gli approcci rigenerativi. Infine, l'alto costo e le sfide della produzione di ATMP su larga scala rendono queste terapie difficili da accedere. Queste sfide evidenziano la necessità di continuare la ricerca e l'innovazione per migliorare le strategie terapeutiche attuali e la modellizzazione della malattia.
Sex as a biological variable in physiology and disease (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei meccanismi molecolari alla base delle differenze sessuali. Le differenze sessuali nella fisiologia e nella malattia possono essere dovute agli ormoni sessuali provenienti dai testicoli o dalle ovaie, tuttavia, le differenze sessuali possono anche essere causate da geni sui cromosomi sessuali che agiscono al di fuori delle gonadi influenzando diversi processi, tra cui lo sviluppo del cancro e la modulazione del sistema immunitario. Oltre ad ascoltare esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione introduttiva ed esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento degli studi pre-dottorali.
Role of microbiota in patients with haematological malignancies undergoing cellular therapies: from translational research to routine clinical practice (ECM)
TIl microbioma comprende la microbiota, i suoi geni associati e il loro ambiente. La microbiota è fondamentale per preservare i tessuti e stimolare l'immunità, ma le sue alterazioni sono state collegate a malattie e difetti nell'immunità. La disbiosi della microbiota dipende da molti fattori, tra cui i regimi chemioterapici, gli antibiotici e la dieta. Il compromesso della funzione della barriera intestinale è una caratteristica prominente della malattia infiammatoria intestinale ed è cruciale anche nella patogenesi della malattia da trapianto contro ospite, una grave e potenzialmente fatale conseguenza del trapianto di cellule staminali ematopoietiche. Infatti, la composizione dei batteri intestinali e i loro metaboliti sono stati trovati in ampi studi prospettici multicentrici essere fortemente associati alla GVHD, alla mortalità correlata al trattamento e alla sopravvivenza complessiva. Pertanto, la possibilità di modulare la microbiota è diventata un argomento rilevante da investigare per trattare condizioni potenzialmente letali. Gli approcci disponibili includono modifiche specifiche della dieta, l'uso di prebiotici e probiotici, ma anche il trapianto di microbiota fecale e il trattamento antibiotico raffinato. Questo seminario affronterà il ruolo traslazionale della microbiota nelle terapie personalizzate in diverse condizioni, dalla malattia alla possibile prevenzione delle complicanze e miglioramento della prognosi.
Communicating research: Short oral presentation - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i dottorandi sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Il workshop si concentra su come presentare efficacemente il proprio lavoro in forma orale in vari contesti, come ad esempio la presentazione di un poster, un "flash talk" o un "elevator pitch". Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
IT course - Dr. Lorenzo Cibrario
Il corso si propone di fornire ai dottorandi conoscenze metodologiche e tecnologiche sull'utilizzo di strumenti legati all'office automation, al networking, al cloud e alla cyber security. Il corso tratterà i seguenti argomenti: utilizzo di base e avanzato di Microsoft Excel, utilizzo avanzato di Microsoft Word, protocolli di comunicazione e protocolli di sicurezza, elementi di base della sicurezza informatica, tecniche di protezione dei dati e tecniche avanzate di sicurezza informatica.
Research Integrity - Dr. Roberto Buccione
Il corso fornisce una panoramica di base dei principi fondamentali di integrità della ricerca, la definizione di cattiva condotta della ricerca e la pratica di ricerca discutibile, una descrizione generale su come affrontare le complesse questioni che possono sorgere durante la pianificazione, condurre e riferire ricerche, nonché l’illustrazione delle funzioni del Research Integrity Office.
Gender Equality - Dr. Simone Mattavelli – Dr. Monica Fabbri
Nonostante i significativi progressi sociali compiuti negli ultimi decenni e l'introduzione di interventi politici mirati, nelle moderne società occidentali persiste uno squilibrio uomo-donna. Le conseguenze di questo fenomeno, noto come pregiudizio di genere, sono state studiate a diversi livelli. Per esempio, le donne sono sottorappresentate quando si tratta di posizioni dirigenziali di alto livello e numerosi studi hanno dimostrato che il pregiudizio di genere nelle discipline scientifiche e nella medicina è tuttora persistente. Inoltre, i pregiudizi di genere possono essere espressi in molti modi, dalle manifestazioni più evidenti a quelle più sottili, come le espressioni linguistiche adottate nelle interazioni quotidiane.
Le ricerche sulla cognizione sociale hanno dimostrato che le radici dei pregiudizi di genere vanno ricercate nel concetto di stereotipo. Gli stereotipi non sono altro che etichette che gli esseri umani tendono ad attribuire a entità e categorie sociali e che guidano il nostro modo di pensare e di comportarci. Seguendo un approccio socio-cognitivo, questo corso si propone di fornire una migliore comprensione dei pregiudizi di genere conoscendo (i) cosa sono gli stereotipi di genere; (ii) come si formano e si alimentano nella nostra società; (iii) quali sono le loro conseguenze; e (iv) quali interventi possono aiutare a smantellarli.
Infine, il corso prevede un approfondimento dedicato al "Gender Equality Plan" approvato da UniSR.
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L'obiettivo del corso è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni incontrati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un'introduzione di base a R, includendo la gestione dei dati, l'analisi statistica e la visualizzazione dei dati. Verranno introdotti elementi di scripting. Il corso comprenderà una struttura pratica e interattiva, con un apprendimento ottenuto principalmente attraverso la presentazione di problemi e soluzioni reali tramite attività pratiche.
Problem Solving Logics - Dr. Enrico Dalla Rosa
L'argomento principale di questo corso è l'errore umano. La nostra specie ha fatto un buon lavoro nel sopravvivere alla lotteria dell'evoluzione, grazie anche a una buona capacità di evitare - nel complesso - errori fatali. Ma la crescente complessità del mondo rende sempre più importante evitare errori che possono avere conseguenze disastrose, soprattutto in alcuni settori, tra cui la medicina.
Anche se ci piace pensare che, di fronte a situazioni impegnative, siamo fondamentalmente razionali, è facile dimostrare che la maggior parte delle persone - anche quelle con un QI molto alto - può commettere, in modo facilmente prevedibile, errori rilevanti. Durante il ciclo di lezioni, cercheremo di vaccinarci contro alcuni dei pregiudizi abbastanza prevedibili che ci spingono a commettere errori, anche se cerchiamo di evitarli nel modo più accurato possibile.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
Diving into the data management plan (DMP) and IRIS - Dr. Silvia Corbetta and Dr. Marco Soriano
Il corso si focalizza su due strumenti essenziali per la ricerca. La prima parte è dedicata al DMP, ovvero un documento strutturato che delinea tutti gli aspetti del ciclo di vita dei dati della ricerca (ad esempio, come verranno organizzati e curati, i formati utilizzati e le misure adottate per la conservazione e condivisione dei dati). La stesura di un DMP consente di affrontare in anticipo tutte le esigenze/sfide che si possono incontrare nel corso di un progetto di ricerca ed è considerata una buona pratica, in quanto rende il lavoro più efficiente e contribuisce alla conservazione a lungo termine dei dati. Dopo aver introdotto le componenti principali del DMP, vengono fornite informazioni pratiche su come redigere ogni sezione del documento. Inoltre, attraverso una sessione di domande e risposte, gli e le studenti hanno la possibilità di chiarire qualsiasi dubbio sul loro DMP.
La seconda parte del corso si concentra sul Institutional Research Information System (IRIS) di UniSR, ovvero l’archivio istituzionale per la gestione delle pubblicazioni e degli altri output scientifici. Dopo aver introdotto i concetti e i principi fondamentali dell'Accesso Aperto, vengono fornite informazioni su come utilizzare IRIS per depositare e diffondere le pubblicazioni.
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.
Courses curriculum-specific:
Current Mechanism Understanding and Treatment Development in Epilepsy (NEN)
L'epilessia è un disturbo altamente eterogeneo che colpisce oltre 50 milioni di persone in tutto il mondo. I pazienti epilettici sono caratterizzati da crisi ricorrenti, che possono variare ampiamente per tipo ed eziologia. Mentre alcuni casi sono chiaramente legati a fattori genetici, altri sono causati da condizioni acquisite come ictus, infezioni, lesioni cerebrali traumatiche o tumori, che possono interrompere i normali schemi di attività cerebrale e portare a crisi. È importante notare che un terzo dei pazienti non risponde ai trattamenti attuali. Questo corso di dottorato approfondirà i meccanismi fondamentali alla base sia dell'epilessia genetica (Dr. Ethan Goldberg, Children's Hospital of Philadelphia) che dell'epilessia acquisita (Dr. Christophe Bernard, Institute of Systems Neuroscience, Aix Marseille Université, Francia). Successivamente, esplorerà le alterazioni secondarie che si verificano nel cervello epilettico e discuterà il potenziale di mirare a queste modifiche per interventi terapeutici. (Dr. Anna Maria Vezzani, Mario Negri Institute for Pharmacological Research). Infine, il corso presenterà approcci terapeutici innovativi basati sulla terapia genica, adatti sia per le epilessie genetiche che acquisite (Prof. Gabriele Lignani, University College London). Tenuto da esperti di rilevo, questo corso offrirà ai partecipanti l'opportunità di approfondire la loro comprensione dell'epilessia e contribuire allo sviluppo di soluzioni innovative per identificare nuovi meccanismi e terapie. Le sessioni mattutine consisteranno in lezioni frontali. Nel pomeriggio del primo giorno, gli studenti saranno invitati a presentare articoli in formato Journal Club. Inoltre, saranno divisi in gruppi di lavoro e a ciascun gruppo verrà assegnata una domanda di ricerca specifica da sviluppare in un breve piano sperimentale. Nel pomeriggio del secondo giorno del corso, questi lavori saranno discussi insieme agli organizzatori e agli esperti. Completando questo corso, i partecipanti acquisiranno le seguenti competenze:
- Comprendere i meccanismi chiave alla base sia dell'epilessia genetica che acquisita
- Conoscere gli strumenti e i modelli di ricerca utilizzati nella ricerca sull'epilessia
- Identificare le sfide nello sviluppo di nuovi trattamenti e terapie per l'epilessia
Relatori: Prof. Michele Simonato, Università di Ferrara (Introduzione); Dr. Ethan Goldberg (Meccanismi alla base delle epilessie genetiche); Dr. Christophe Bernard (Meccanismi delle epilessie acquisite); Dr. Anna Maria Vezzani (Modificazioni secondarie nel cervello epilettico); Prof. Gabriele Lignani (Terapia genica nell'epilessia)
Innovative approaches to model and treat muscular and neuromuscular diseases (GCT)
Le malattie muscolari e neuromuscolari rappresentano un gruppo eterogeneo di disturbi con un significativo impatto medico e sociale. Le malattie neuromuscolari e muscolari condividono diverse caratteristiche chiave, in quanto entrambe interessano i componenti del sistema motorio responsabili dei movimenti, della respirazione, della postura e di altre funzioni fisiche. Entrambi i tipi di malattie spesso causano debolezza muscolare, atrofia o funzione compromessa, sia per danni diretti ai muscoli (come nelle malattie muscolari) sia per la distruzione dell'input neurale necessario per l'attivazione e il mantenimento dei muscoli (come nelle malattie neuromuscolari). Molte di queste condizioni hanno una base genetica, con mutazioni in proteine strutturali (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare) o in proteine necessarie per la trasmissione della giunzione neuromuscolare (ad esempio, i recettori dell'acetilcolina nella miastenia grave). Entrambe le categorie possono comportare una degenerazione progressiva, che porta a ridotta mobilità, affaticamento e una qualità della vita compromessa. Affrontare queste condizioni richiede un approccio multidisciplinare, combinando intuizioni dalla genetica, neurologia e medicina rigenerativa per sviluppare trattamenti efficaci.
Il trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari è stato rivoluzionato dall'introduzione di innovativi Prodotti Medicinali per Terapie Avanzate (ATMP), che includono cellule modificate geneticamente, vettori virali e strumenti molecolari innovativi. La terapia genica offre la possibilità di affrontare le cause alla base di queste malattie introducendo, riparando o silenziando sequenze genetiche specifiche. Gli approcci basati sulle cellule staminali permettono la sostituzione di cellule muscolari danneggiate o disfunzionali e forniscono piattaforme per la somministrazione sostenuta di proteine. Inoltre, la modellizzazione della malattia, utilizzando cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) derivate dai pazienti, organoidi o modelli di topo transgenici, è diventata fondamentale per comprendere i meccanismi molecolari alla base dei disturbi muscolari e neuromuscolari. Questi modelli ricapitolano la patologia della malattia, permettendo di testare strategie terapeutiche e identificare nuovi target azionabili. Queste modalità avanzate sono anche combinate con approcci di medicina di precisione per adattare i trattamenti ai profili genetici e fenotipici individuali dei pazienti. Queste terapie all'avanguardia rappresentano un cambiamento di paradigma nell'affrontare la patologia sottostante delle malattie muscolari e neuromuscolari, offrendo speranza per un'efficacia a lungo termine e un miglioramento degli esiti per i pazienti.
Tuttavia, nonostante i recenti progressi, gli ATMP mirati al trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari affrontano diverse sfide che limitano la loro efficacia attuale. La consegna efficiente rimane un ostacolo importante, poiché tessuti ampi come i muscoli scheletrici e il sistema nervoso periferico richiedono una distribuzione diffusa e mirata, spesso ostacolata da barriere come la barriera emato-neurale. Le risposte immunitarie ai vettori virali, così come la grande dimensione di alcuni geni terapeutici (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare di Duchenne), complicano ulteriormente il trattamento. La durata degli effetti terapeutici è anche una questione, poiché l'espressione del trasgene o l'innesto cellulare spesso diminuiscono nel tempo nell'ambiente tissutale malato. Inoltre, l'eterogeneità di queste malattie e la necessità di mirare a più tessuti, come il muscolo scheletrico e il cuore, complicano la progettazione della terapia. I modelli sperimentali attuali spesso non replicano le complessità delle malattie umane, limitando il successo predittivo, mentre l'infiammazione cronica e la fibrosi nei tessuti colpiti ostacolano gli approcci rigenerativi. Infine, l'alto costo e le sfide della produzione di ATMP su larga scala rendono queste terapie difficili da accedere. Queste sfide evidenziano la necessità di continuare la ricerca e l'innovazione per migliorare le strategie terapeutiche attuali e la modellizzazione della malattia.
Sex as a biological variable in physiology and disease (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei meccanismi molecolari alla base delle differenze sessuali. Le differenze sessuali nella fisiologia e nella malattia possono essere dovute agli ormoni sessuali provenienti dai testicoli o dalle ovaie, tuttavia, le differenze sessuali possono anche essere causate da geni sui cromosomi sessuali che agiscono al di fuori delle gonadi influenzando diversi processi, tra cui lo sviluppo del cancro e la modulazione del sistema immunitario. Oltre ad ascoltare esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione introduttiva ed esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento degli studi pre-dottorali.
Role of microbiota in patients with haematological malignancies undergoing cellular therapies: from translational research to routine clinical practice (ECM)
TIl microbioma comprende la microbiota, i suoi geni associati e il loro ambiente. La microbiota è fondamentale per preservare i tessuti e stimolare l'immunità, ma le sue alterazioni sono state collegate a malattie e difetti nell'immunità. La disbiosi della microbiota dipende da molti fattori, tra cui i regimi chemioterapici, gli antibiotici e la dieta. Il compromesso della funzione della barriera intestinale è una caratteristica prominente della malattia infiammatoria intestinale ed è cruciale anche nella patogenesi della malattia da trapianto contro ospite, una grave e potenzialmente fatale conseguenza del trapianto di cellule staminali ematopoietiche. Infatti, la composizione dei batteri intestinali e i loro metaboliti sono stati trovati in ampi studi prospettici multicentrici essere fortemente associati alla GVHD, alla mortalità correlata al trattamento e alla sopravvivenza complessiva. Pertanto, la possibilità di modulare la microbiota è diventata un argomento rilevante da investigare per trattare condizioni potenzialmente letali. Gli approcci disponibili includono modifiche specifiche della dieta, l'uso di prebiotici e probiotici, ma anche il trapianto di microbiota fecale e il trattamento antibiotico raffinato. Questo seminario affronterà il ruolo traslazionale della microbiota nelle terapie personalizzate in diverse condizioni, dalla malattia alla possibile prevenzione delle complicanze e miglioramento della prognosi.
Communicating research: Writing a paper - The editorial process - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i dottorandi sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Gli argomenti trattati comprendono la comprensione della struttura e del contenuto di un manoscritto, la creazione di figure e la scrittura di titoli e abstract efficaci. I partecipanti impareranno anche a orientarsi nel processo editoriale delle riviste. Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
Scientific Publishing - Dr. Roberto Buccione
Il corso si basa sul presupposto che l'impatto delle scoperte scientifiche sarebbe molto limitato senza la comunicazione dei risultati ai pari. Tale comunicazione può avvenire sotto molte forme, ma più tipicamente, come pubblicazioni accademiche convalidate da peer-review. Saranno descritti i meccanismi base della peer-review, il processo editoriale nelle riviste scientifiche e infine informazioni sulla corretta attribuzione della authorship, sulla base delle regole accettate dalla comunità e la ripartizione delle responsabilità e dei diritti connessi con la authorship.
Gender Medicine - Prof. Alaide Chieffo - Prof. Andrea Salonia
Nel corso della storia, la medicina e la biologia sono state sviluppate utilizzando un approccio androcentrico, generalizzando i risultati ai soggetti di sesso femminile e limitando le differenze di genere legate esclusivamente alle questioni di riproduzione. Il corso "Gender Medicine" presenterà un'introduzione alla medicina di nuova generazione, spiegherà le definizioni, evidenzierà i riferimenti normativi e le risorse e discuterà esempi e implicazioni per la ricerca e i servizi sanitari.
Writing Successful Fellowship Applications - Dr. Thiago Carvalho and Dr. David del Álamo (Fellowsherpa)
Per molti ricercatori all'inizio della carriera, scrivere una domanda di borsa di studio sarà la prima esperienza con il sistema di finanziamento scientifico altamente competitivo. Il corso interattivo di due giorni di Fellowsherpa espone ai partecipanti alcune delle più prestigiose borse di studio internazionali, tra cui i programmi post-dottorato Marie Skłodowska-Curie, EMBO e Human Frontier Science Program.
Statistical methods in biomedical research - Prof. Paola Rancoita and Prof. Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti di base e avanzati per la raccolta, l'organizzazione e l'analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è suddiviso in due moduli:
MODULO 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULO 2: Creare modelli delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli è organizzata per competenze e non per anno di iscrizione
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
The course covers practical topics in coding with R. The aim of the course is to show how R coding can be used to solve common issues encountered by neuroscientists. The course will provide a basic introduction to R, covering data management, statistical modelling and data visualization. Elements of scripting will be introduced.
The course will have a practical and interactive layout, with learning achieved mainly through presentation of real-life problems and solutions via hands-on activities.
Business Planning - Dr. Giancarlo Monza
La ricerca e sviluppo (R&S) di oggi è la pratica medica di domani. Purtroppo, la sostenibilità della R&S è a rischio. Altri settori altamente innovativi (ad esempio l'industria aerospaziale, l'IT e anche... l'esercito) hanno cercato di affrontare il problema della sostenibilità migliorando le loro capacità di pianificazione/esecuzione dei progetti e la loro attenzione ai fattori umani.
Durante le lezioni verranno esaminate le tecniche di base della pianificazione dei progetti e delle prestazioni dei team (=persone) per minimizzare/prevenire gli errori umani, concentrandosi sulla peculiarità della R&S in ambito sanitario, dove l'etica e l'approccio incentrato sul paziente sono fondamentali. Verranno presentati esempi pratici di progetti falliti e completati con successo nel settore sanitario.
Fundamentals of AI in medicine - Dr. Patrick Scuri - Dr. Andrea Corvaglia - Dr. Marco Denti - Dr. Alberto Traverso
L'intelligenza artificiale (IA) sta guadagnando sempre più popolarità nel settore sanitario. Le tecnologie che consentono l'automazione di compiti clinici che richiedono tempo o i sistemi di supporto alle decisioni cliniche basati sull'apprendimento automatico, una branca dell'IA, potenzialmente miglioreranno le cure oncologiche. Tuttavia, l'uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati al di fuori dell'ambito clinico, senza coinvolgere gli operatori sanitari, ridurrà l'impatto clinico, creando sfiducia nell'IA. Presenteremo ai giovani ricercatori clinici le basi dell'IA, compresa una panoramica sui principali algoritmi di ML e le loro applicazioni con i dati sanitari, la progettazione di studi clinici che prevedono lo sviluppo di algoritmi di IA e le questioni etiche e di privacy legate all'uso di algoritmi di IA in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.
Open Science in practice - Dr. Silvia Corbetta - Dr. Maya Fedeli - Dr. Marco Soriano
L'approccio Open Science include tutte le pratiche che promuovono l'accessibilità e la trasparenza a tutti i livelli del ciclo di vita del progetto di ricerca, per garantire la riproducibilità e l'utilità sociale della ricerca scientifica. Il corso sarà diviso in due incontri. Un incontro verterà sui principi fondamentali dell'approccio Open Science, fornendo informazioni pratiche, linee guida e strumenti su come rendere aperte le pubblicazioni scientifiche (e gli altri output della ricerca) e su come adottare una metodologia, quale la Citizen Science, volta a favorire la collaborazione tra la comunità scientifica e la società. L'altro incontro sarà incentrato sulla restituzione circa i Data Management Plans (DMP), precedentemente sottomessi dagli e dalle studenti, e verranno discusse le tematiche meno chiare circa la gestione responsabile e condivisione dei dati della ricerca.
SPSS tutorial- Prof. Alessandro Ambrosi
Questo tutorial di due ore si concentrerà sull'affrontare domande rilevanti per la pratica clinica quotidiana, con particolare enfasi sulle metodologie di ricerca clinica. I partecipanti saranno guidati attraverso le principali analisi statistiche applicabili ai dati clinici reali. Il tutorial utilizzerà il software IBM SPSS e gli studenti adotteranno un approccio pratico e esperienziale per rafforzare la loro comprensione.
GraphPad tutorial - Prof. Giovanni Tonon
Durante questo tutorial di 2 ore, verranno presentate domande derivanti dalla pratica quotidiana della ricerca, e gli studenti saranno guidati attraverso gli strumenti statistici e gli approcci più appropriati per affrontarle. Verrà utilizzato il software GraphPad Prism e gli studenti riceveranno una formazione sul suo utilizzo
Courses curriculum-specific:
Current Mechanism Understanding and Treatment Development in Epilepsy (NEN)
L'epilessia è un disturbo altamente eterogeneo che colpisce oltre 50 milioni di persone in tutto il mondo. I pazienti epilettici sono caratterizzati da crisi ricorrenti, che possono variare ampiamente per tipo ed eziologia. Mentre alcuni casi sono chiaramente legati a fattori genetici, altri sono causati da condizioni acquisite come ictus, infezioni, lesioni cerebrali traumatiche o tumori, che possono interrompere i normali schemi di attività cerebrale e portare a crisi. È importante notare che un terzo dei pazienti non risponde ai trattamenti attuali. Questo corso di dottorato approfondirà i meccanismi fondamentali alla base sia dell'epilessia genetica (Dr. Ethan Goldberg, Children's Hospital of Philadelphia) che dell'epilessia acquisita (Dr. Christophe Bernard, Institute of Systems Neuroscience, Aix Marseille Université, Francia). Successivamente, esplorerà le alterazioni secondarie che si verificano nel cervello epilettico e discuterà il potenziale di mirare a queste modifiche per interventi terapeutici. (Dr. Anna Maria Vezzani, Mario Negri Institute for Pharmacological Research). Infine, il corso presenterà approcci terapeutici innovativi basati sulla terapia genica, adatti sia per le epilessie genetiche che acquisite (Prof. Gabriele Lignani, University College London). Tenuto da esperti di rilevo, questo corso offrirà ai partecipanti l'opportunità di approfondire la loro comprensione dell'epilessia e contribuire allo sviluppo di soluzioni innovative per identificare nuovi meccanismi e terapie. Le sessioni mattutine consisteranno in lezioni frontali. Nel pomeriggio del primo giorno, gli studenti saranno invitati a presentare articoli in formato Journal Club. Inoltre, saranno divisi in gruppi di lavoro e a ciascun gruppo verrà assegnata una domanda di ricerca specifica da sviluppare in un breve piano sperimentale. Nel pomeriggio del secondo giorno del corso, questi lavori saranno discussi insieme agli organizzatori e agli esperti. Completando questo corso, i partecipanti acquisiranno le seguenti competenze:
- Comprendere i meccanismi chiave alla base sia dell'epilessia genetica che acquisita
- Conoscere gli strumenti e i modelli di ricerca utilizzati nella ricerca sull'epilessia
- Identificare le sfide nello sviluppo di nuovi trattamenti e terapie per l'epilessia
Relatori: Prof. Michele Simonato, Università di Ferrara (Introduzione); Dr. Ethan Goldberg (Meccanismi alla base delle epilessie genetiche); Dr. Christophe Bernard (Meccanismi delle epilessie acquisite); Dr. Anna Maria Vezzani (Modificazioni secondarie nel cervello epilettico); Prof. Gabriele Lignani (Terapia genica nell'epilessia)
Innovative approaches to model and treat muscular and neuromuscular diseases (GCT)
Le malattie muscolari e neuromuscolari rappresentano un gruppo eterogeneo di disturbi con un significativo impatto medico e sociale. Le malattie neuromuscolari e muscolari condividono diverse caratteristiche chiave, in quanto entrambe interessano i componenti del sistema motorio responsabili dei movimenti, della respirazione, della postura e di altre funzioni fisiche. Entrambi i tipi di malattie spesso causano debolezza muscolare, atrofia o funzione compromessa, sia per danni diretti ai muscoli (come nelle malattie muscolari) sia per la distruzione dell'input neurale necessario per l'attivazione e il mantenimento dei muscoli (come nelle malattie neuromuscolari). Molte di queste condizioni hanno una base genetica, con mutazioni in proteine strutturali (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare) o in proteine necessarie per la trasmissione della giunzione neuromuscolare (ad esempio, i recettori dell'acetilcolina nella miastenia grave). Entrambe le categorie possono comportare una degenerazione progressiva, che porta a ridotta mobilità, affaticamento e una qualità della vita compromessa. Affrontare queste condizioni richiede un approccio multidisciplinare, combinando intuizioni dalla genetica, neurologia e medicina rigenerativa per sviluppare trattamenti efficaci.
Il trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari è stato rivoluzionato dall'introduzione di innovativi Prodotti Medicinali per Terapie Avanzate (ATMP), che includono cellule modificate geneticamente, vettori virali e strumenti molecolari innovativi. La terapia genica offre la possibilità di affrontare le cause alla base di queste malattie introducendo, riparando o silenziando sequenze genetiche specifiche. Gli approcci basati sulle cellule staminali permettono la sostituzione di cellule muscolari danneggiate o disfunzionali e forniscono piattaforme per la somministrazione sostenuta di proteine. Inoltre, la modellizzazione della malattia, utilizzando cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) derivate dai pazienti, organoidi o modelli di topo transgenici, è diventata fondamentale per comprendere i meccanismi molecolari alla base dei disturbi muscolari e neuromuscolari. Questi modelli ricapitolano la patologia della malattia, permettendo di testare strategie terapeutiche e identificare nuovi target azionabili. Queste modalità avanzate sono anche combinate con approcci di medicina di precisione per adattare i trattamenti ai profili genetici e fenotipici individuali dei pazienti. Queste terapie all'avanguardia rappresentano un cambiamento di paradigma nell'affrontare la patologia sottostante delle malattie muscolari e neuromuscolari, offrendo speranza per un'efficacia a lungo termine e un miglioramento degli esiti per i pazienti.
Tuttavia, nonostante i recenti progressi, gli ATMP mirati al trattamento delle malattie muscolari e neuromuscolari affrontano diverse sfide che limitano la loro efficacia attuale. La consegna efficiente rimane un ostacolo importante, poiché tessuti ampi come i muscoli scheletrici e il sistema nervoso periferico richiedono una distribuzione diffusa e mirata, spesso ostacolata da barriere come la barriera emato-neurale. Le risposte immunitarie ai vettori virali, così come la grande dimensione di alcuni geni terapeutici (ad esempio, la distrofina nella distrofia muscolare di Duchenne), complicano ulteriormente il trattamento. La durata degli effetti terapeutici è anche una questione, poiché l'espressione del trasgene o l'innesto cellulare spesso diminuiscono nel tempo nell'ambiente tissutale malato. Inoltre, l'eterogeneità di queste malattie e la necessità di mirare a più tessuti, come il muscolo scheletrico e il cuore, complicano la progettazione della terapia. I modelli sperimentali attuali spesso non replicano le complessità delle malattie umane, limitando il successo predittivo, mentre l'infiammazione cronica e la fibrosi nei tessuti colpiti ostacolano gli approcci rigenerativi. Infine, l'alto costo e le sfide della produzione di ATMP su larga scala rendono queste terapie difficili da accedere. Queste sfide evidenziano la necessità di continuare la ricerca e l'innovazione per migliorare le strategie terapeutiche attuali e la modellizzazione della malattia.
Sex as a biological variable in physiology and disease (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei meccanismi molecolari alla base delle differenze sessuali. Le differenze sessuali nella fisiologia e nella malattia possono essere dovute agli ormoni sessuali provenienti dai testicoli o dalle ovaie, tuttavia, le differenze sessuali possono anche essere causate da geni sui cromosomi sessuali che agiscono al di fuori delle gonadi influenzando diversi processi, tra cui lo sviluppo del cancro e la modulazione del sistema immunitario. Oltre ad ascoltare esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione introduttiva ed esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento degli studi pre-dottorali.
Role of microbiota in patients with haematological malignancies undergoing cellular therapies: from translational research to routine clinical practice (ECM)
TIl microbioma comprende la microbiota, i suoi geni associati e il loro ambiente. La microbiota è fondamentale per preservare i tessuti e stimolare l'immunità, ma le sue alterazioni sono state collegate a malattie e difetti nell'immunità. La disbiosi della microbiota dipende da molti fattori, tra cui i regimi chemioterapici, gli antibiotici e la dieta. Il compromesso della funzione della barriera intestinale è una caratteristica prominente della malattia infiammatoria intestinale ed è cruciale anche nella patogenesi della malattia da trapianto contro ospite, una grave e potenzialmente fatale conseguenza del trapianto di cellule staminali ematopoietiche. Infatti, la composizione dei batteri intestinali e i loro metaboliti sono stati trovati in ampi studi prospettici multicentrici essere fortemente associati alla GVHD, alla mortalità correlata al trattamento e alla sopravvivenza complessiva. Pertanto, la possibilità di modulare la microbiota è diventata un argomento rilevante da investigare per trattare condizioni potenzialmente letali. Gli approcci disponibili includono modifiche specifiche della dieta, l'uso di prebiotici e probiotici, ma anche il trapianto di microbiota fecale e il trattamento antibiotico raffinato. Questo seminario affronterà il ruolo traslazionale della microbiota nelle terapie personalizzate in diverse condizioni, dalla malattia alla possibile prevenzione delle complicanze e miglioramento della prognosi.
How to review scientific papers - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i e le studenti di dottorato sui principi e le pratiche della peer review. Gli argomenti trattati comprendono gli elementi chiave di una buona peer review e il ruolo della peer review nella pubblicazione di una scienza che sia riproducibile. Si discutono anche considerazioni etiche, come i conflitti di interesse, e si forniscono linee guida ai giovani scienziati su come diventare bravi revisori. Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
Science Communication - Dr. Maya Fedeli
Il corso di Science Communication è progettato per sviluppare le competenze di comunicazione degli e delle studenti di dottorato, consentendo loro di trasmettere in modo chiaro, coinvolgente e accessibile i complessi concetti scientifici tipici dell’attività di ricerca a un pubblico più ampio. Durante il corso, gli e le studenti acquisiranno una comprensione delle strategie di comunicazione della scienza, impareranno a tradurre il linguaggio tecnico in un formato comprensibile per il pubblico generale e affineranno le loro abilità nell'utilizzo di diverse piattaforme e strumenti di comunicazione. Dopo un’introduzione sui fondamenti della comunicazione scientifica, verranno affrontati temi quali tecniche di scrittura e l'uso di linguaggio chiaro e accessibile, sviluppo delle abilità di presentazione, comunicazione visuale, uso corretto e d’impatto dei media e social media.
Open Science in practice: principles and tools for open access to scientific publications and research data - Dr. Silvia Corbetta - Dr. Marco Soriano
L'approccio Open Science (anche noto come “Scienza Aperta”) include tutte le pratiche che promuovono l'accessibilità e la trasparenza durante l’intero ciclo di vita di un progetto di ricerca. Il corso introduce i concetti chiave e i principi fondamentali dell'Open Science (come l’Accesso Aperto e la condivisione dei dati) e fornisce le linee guida e gli strumenti su come rendere ad accesso aperto le pubblicazioni e i dati, per garantire la riproducibilità e l'utilità sociale della ricerca scientifica. Inoltre, il corso fornisce le principali nozioni in merito al corretto utilizzo sia dell’archivio istituzionale per la gestione delle pubblicazioni (IRIS) che dell’archivio per il deposito e la condivisione dei dati (ORDR).
Statistical methods in biomedical research - Prof. Paola Rancoita and Prof Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti di base e avanzati per la raccolta, l'organizzazione e l'analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è suddiviso in due moduli:
MODULO 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULO 2: Creare modelli delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli è organizzata per competenze e non per anno di iscrizione
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L'obiettivo del corso è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni incontrati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un'introduzione di base a R, includendo la gestione dei dati, l'analisi statistica e la visualizzazione dei dati. Verranno introdotti elementi di scripting. Il corso comprenderà una struttura pratica e interattiva, con un apprendimento ottenuto principalmente attraverso la presentazione di problemi e soluzioni reali tramite attività pratiche.
Project Assessment - Dr. Gianni Navalesi
E cosa succede se il mio progetto scientifico/clinico non va bene? Dobbiamo trovare un'altra opportunità o dobbiamo buttare nel cestino quello che abbiamo fatto? Ci concentreremo sulla valutazione dell'importanza di avere a disposizione tecniche di approccio basato sul rischio, pianificazione del rischio e misure di minimizzazione del rischio. Questi strumenti mirano a mitigare eventuali scostamenti indesiderati dall'obiettivo scientifico.
A questo proposito, verrà sottolineata l'importanza di avere in mente altre potenziali soluzioni nel caso in cui l'obiettivo primario non possa essere raggiunto. Verranno illustrati alcuni esempi di farmaci che sono stati riproposti da un'indicazione clinica a un'altra (ad esempio, il Sildenafil), nonché l'opportunità di passare ad altri settori come i dispositivi medici o gli integratori alimentari.
Fundamentals of AI in medicine - Dr. Patrick Scuri - Dr. Andrea Corvaglia - Dr. Marco Denti - Dr. Alberto Traverso
L'intelligenza artificiale (IA) sta guadagnando sempre più popolarità nel settore sanitario. Le tecnologie che consentono l'automazione di compiti clinici che richiedono tempo o i sistemi di supporto alle decisioni cliniche basati sull'apprendimento automatico, una branca dell'IA, potenzialmente miglioreranno le cure oncologiche. Tuttavia, l'uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati al di fuori dell'ambito clinico, senza coinvolgere gli operatori sanitari, ridurrà l'impatto clinico, creando sfiducia nell'IA. Presenteremo ai giovani ricercatori clinici le basi dell'IA, compresa una panoramica sui principali algoritmi di ML e le loro applicazioni con i dati sanitari, la progettazione di studi clinici che prevedono lo sviluppo di algoritmi di IA e le questioni etiche e di privacy legate all'uso di algoritmi di IA in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.
SPSS tutorial- Prof. Alessandro Ambrosi
Questo tutorial di due ore si concentrerà sull'affrontare domande rilevanti per la pratica clinica quotidiana, con particolare enfasi sulle metodologie di ricerca clinica. I partecipanti saranno guidati attraverso le principali analisi statistiche applicabili ai dati clinici reali. Il tutorial utilizzerà il software IBM SPSS e gli studenti adotteranno un approccio pratico e esperienziale per rafforzare la loro comprensione.
GraphPad tutorial - Prof. Giovanni Tonon
Durante questo tutorial di 2 ore, verranno presentate domande derivanti dalla pratica quotidiana della ricerca, e gli studenti saranno guidati attraverso gli strumenti statistici e gli approcci più appropriati per affrontarle. Verrà utilizzato il software GraphPad Prism e gli studenti riceveranno una formazione sul suo utilizzo
Attività didattica a.a. 2023/2024
Di seguito è riportato il programma formativo previsto per l'a.a. 2023/2024
Courses curriculum-specific:
Targeting RNA-binding proteins in neuronal degeneration and repair (NEN)
Le proteine che legano l'RNA (RBP) svolgono ruoli essenziali nello sviluppo, nella funzione e nel mantenimento dei neuroni, controllando con precisione tutti gli aspetti della regolazione dell'mRNA, tra cui lo splicing alternativo, la stabilità, il traffico e la traduzione. È ormai chiaro che diversi disturbi neurologici sono legati a erronee funzioni e localizzazione delle RBP, e il bersaglio di questo gruppo di proteine potrebbe rappresentare un'interessante strategia terapeutica per prevenire la perdita neuronale e/o promuovere la riparazione neuronale. Questo corso fornirà una panoramica dei più recenti progressi nelle funzioni delle RBP nella riparazione neurale dopo una lesione, nonché le ultime evidenze che dimostrano come il targeting delle RBP possa rappresentare una nuova ed efficace via per il trattamento dei disturbi neurodegenerativi.
Pluripotent stem cells and next generation therapies (GCT)
L'avvento delle cellule staminali pluripotenti ha rivoluzionato il panorama della medicina rigenerativa. Intraprenderemo questo viaggio trasformativo con il nostro corso di dottorato all'avanguardia incentrato su cellule staminali pluripotenti e terapie di nuova generazione. Approfondiremo come le cellule staminali pluripotenti possano essere sfruttate per progettare e testare nuovi approcci terapeutici, esplorando la loro capacità unica di differenziarsi in diversi tipi di cellule. Il programma coprirà gli ultimi progressi nella ricerca sulle cellule staminali, tra cui l'editing del genoma basato su CRISPR e gli approcci di biologia sintetica, e porrà l'accento sulla traduzione delle intuizioni scientifiche in terapie innovative, promuovendo un profondo apprezzamento per le dimensioni etiche e normative delle applicazioni delle cellule staminali.
Molecular mechanisms of drug resistance in cells (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei processi molecolari che le cellule mettono in atto per adattarsi alle terapie ed eludere la morte. In dettaglio, il corso sarà suddiviso in tre sessioni per avere una panoramica su i) metodi quantitativi innovativi per valutare la resistenza ai farmaci; ii) epidemiologia ed evoluzione dei meccanismi di resistenza nei microrganismi e iii) meccanismi di resistenza acquisita alla terapia mirata e all'immunoterapia. Oltre a conoscere i meccanismi molecolari di resistenza ai farmaci nelle cellule da parte di esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione frontale e di esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento dei loro studi di dottorato.
Biomarkers for precision medicine (ECM)
Communicating research: Short oral presentation - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i dottorandi sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Il workshop si concentra su come presentare efficacemente il proprio lavoro in forma orale in vari contesti, come ad esempio la presentazione di un poster, un "flash talk" o un "elevator pitch". Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
IT course - Dr. Lorenzo Cibrario
Il corso si propone di fornire ai dottorandi conoscenze metodologiche e tecnologiche sull'utilizzo di strumenti legati all'office automation, al networking, al cloud e alla cyber security. Il corso tratterà i seguenti argomenti: utilizzo di base e avanzato di Microsoft Excel, utilizzo avanzato di Microsoft Word, protocolli di comunicazione e protocolli di sicurezza, elementi di base della sicurezza informatica, tecniche di protezione dei dati e tecniche avanzate di sicurezza informatica.
Research Integrity (parte I) - Dr. Roberto Buccione
Il corso fornisce una panoramica di base dei principi fondamentali di integrità della ricerca, la definizione di cattiva condotta della ricerca e la pratica di ricerca discutibile, una descrizione generale su come affrontare le complesse questioni che possono sorgere durante la pianificazione, conduzione e analisi di ricerche scientifiche, nonché l’illustrazione delle funzioni del Research Integrity Office. La verifica primaria di qualsiasi risultato scientifico è la sua riproducibilità, che però può avvenire solo quando tutti i passaggi importanti possono essere ripercorsi. Dovrebbero quindi essere documentati con sufficiente completezza in modo che una persona che abbia familiarità con l'argomento sia in grado di ricostruire gli esperimenti e le considerazioni coinvolte. Il log/workbook noto anche come quaderno di laboratorio (cartaceo o digitale) è il repository centrale per la registrazione dei protocolli e delle procedure sperimentali. Il corso fornisce una panoramica dettagliata delle normative vigenti e consigli generali sulla registrazione degli esperimenti e dei dati nei quaderni di laboratorio.
Gender Equality - Dr. Simone Mattavelli – Dr. Monica Fabbri
Nonostante i significativi progressi sociali compiuti negli ultimi decenni e l'introduzione di interventi politici mirati, nelle moderne società occidentali persiste uno squilibrio uomo-donna. Le conseguenze di questo fenomeno, noto come pregiudizio di genere, sono state studiate a diversi livelli. Per esempio, le donne sono sottorappresentate quando si tratta di posizioni dirigenziali di alto livello e numerosi studi hanno dimostrato che il pregiudizio di genere nelle discipline scientifiche e nella medicina è tuttora persistente. Inoltre, i pregiudizi di genere possono essere espressi in molti modi, dalle manifestazioni più evidenti a quelle più sottili, come le espressioni linguistiche adottate nelle interazioni quotidiane.
Le ricerche sulla cognizione sociale hanno dimostrato che le radici dei pregiudizi di genere vanno ricercate nel concetto di stereotipo. Gli stereotipi non sono altro che etichette che gli esseri umani tendono ad attribuire a entità e categorie sociali e che guidano il nostro modo di pensare e di comportarci. Seguendo un approccio socio-cognitivo, questo corso si propone di fornire una migliore comprensione dei pregiudizi di genere conoscendo (i) cosa sono gli stereotipi di genere; (ii) come si formano e si alimentano nella nostra società; (iii) quali sono le loro conseguenze; e (iv) quali interventi possono aiutare a smantellarli.
Infine, il corso prevede un approfondimento dedicato al "Gender Equality Plan" approvato da UniSR.
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L'obiettivo del corso è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni incontrati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un'introduzione di base a R, includendo la gestione dei dati, l'analisi statistica e la visualizzazione dei dati. Verranno introdotti elementi di scripting. Il corso comprenderà una struttura pratica e interattiva, con un apprendimento ottenuto principalmente attraverso la presentazione di problemi e soluzioni reali tramite attività pratiche.
Problem Solving Logics - Dr. Enrico Dalla Rosa
L'argomento principale di questo corso è l'errore umano. La nostra specie ha fatto un buon lavoro nel sopravvivere alla lotteria dell'evoluzione, grazie anche a una buona capacità di evitare - nel complesso - errori fatali. Ma la crescente complessità del mondo rende sempre più importante evitare errori che possono avere conseguenze disastrose, soprattutto in alcuni settori, tra cui la medicina.
Anche se ci piace pensare che, di fronte a situazioni impegnative, siamo fondamentalmente razionali, è facile dimostrare che la maggior parte delle persone - anche quelle con un QI molto alto - può commettere, in modo facilmente prevedibile, errori rilevanti. Durante il ciclo di lezioni, cercheremo di vaccinarci contro alcuni dei pregiudizi abbastanza prevedibili che ci spingono a commettere errori, anche se cerchiamo di evitarli nel modo più accurato possibile.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
Diving into the data management plan (DMP) and IRIS - Dr. Silvia Corbetta and Dr. Marco Soriano
Il corso si focalizza su due strumenti essenziali per la ricerca. La prima parte è dedicata al DMP, ovvero un documento strutturato che delinea tutti gli aspetti del ciclo di vita dei dati della ricerca (ad esempio, come verranno organizzati e curati, i formati utilizzati e le misure adottate per la conservazione e condivisione dei dati). La stesura di un DMP consente di affrontare in anticipo tutte le esigenze/sfide che si possono incontrare nel corso di un progetto di ricerca ed è considerata una buona pratica, in quanto rende il lavoro più efficiente e contribuisce alla conservazione a lungo termine dei dati. Dopo aver introdotto le componenti principali del DMP, vengono fornite informazioni pratiche su come redigere ogni sezione del documento. Inoltre, attraverso una sessione di domande e risposte, gli e le studenti hanno la possibilità di chiarire qualsiasi dubbio sul loro DMP.
La seconda parte del corso si concentra sul Institutional Research Information System (IRIS) di UniSR, ovvero l’archivio istituzionale per la gestione delle pubblicazioni e degli altri output scientifici. Dopo aver introdotto i concetti e i principi fondamentali dell'Accesso Aperto, vengono fornite informazioni su come utilizzare IRIS per depositare e diffondere le pubblicazioni.
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.
Courses curriculum-specific:
Targeting RNA-binding proteins in neuronal degeneration and repair (NEN)
Le proteine che legano l'RNA (RBP) svolgono ruoli essenziali nello sviluppo, nella funzione e nel mantenimento dei neuroni, controllando con precisione tutti gli aspetti della regolazione dell'mRNA, tra cui lo splicing alternativo, la stabilità, il traffico e la traduzione. È ormai chiaro che diversi disturbi neurologici sono legati a erronee funzioni e localizzazione delle RBP, e il bersaglio di questo gruppo di proteine potrebbe rappresentare un'interessante strategia terapeutica per prevenire la perdita neuronale e/o promuovere la riparazione neuronale. Questo corso fornirà una panoramica dei più recenti progressi nelle funzioni delle RBP nella riparazione neurale dopo una lesione, nonché le ultime evidenze che dimostrano come il targeting delle RBP possa rappresentare una nuova ed efficace via per il trattamento dei disturbi neurodegenerativi.
Pluripotent stem cells and next generation therapies (GCT)
L'avvento delle cellule staminali pluripotenti ha rivoluzionato il panorama della medicina rigenerativa. Intraprenderemo questo viaggio trasformativo con il nostro corso di dottorato all'avanguardia incentrato su cellule staminali pluripotenti e terapie di nuova generazione. Approfondiremo come le cellule staminali pluripotenti possano essere sfruttate per progettare e testare nuovi approcci terapeutici, esplorando la loro capacità unica di differenziarsi in diversi tipi di cellule. Il programma coprirà gli ultimi progressi nella ricerca sulle cellule staminali, tra cui l'editing del genoma basato su CRISPR e gli approcci di biologia sintetica, e porrà l'accento sulla traduzione delle intuizioni scientifiche in terapie innovative, promuovendo un profondo apprezzamento per le dimensioni etiche e normative delle applicazioni delle cellule staminali.
Molecular mechanisms of drug resistance in cells (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei processi molecolari che le cellule mettono in atto per adattarsi alle terapie ed eludere la morte. In dettaglio, il corso sarà suddiviso in tre sessioni per avere una panoramica su i) metodi quantitativi innovativi per valutare la resistenza ai farmaci; ii) epidemiologia ed evoluzione dei meccanismi di resistenza nei microrganismi e iii) meccanismi di resistenza acquisita alla terapia mirata e all'immunoterapia. Oltre a conoscere i meccanismi molecolari di resistenza ai farmaci nelle cellule da parte di esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione frontale e di esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento dei loro studi di dottorato.
Biomarkers for precision medicine (ECM)
Communicating research: Writing a paper - The editorial process - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i dottorandi sui principi, le pratiche e le strategie della pubblicazione scientifica. Gli argomenti trattati comprendono la comprensione della struttura e del contenuto di un manoscritto, la creazione di figure e la scrittura di titoli e abstract efficaci. I partecipanti impareranno anche a orientarsi nel processo editoriale delle riviste. Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
Research Integrity (parte II) - Dr. Roberto Buccione
Il valore e l'impatto delle scoperte scientifiche sarebbero molto limitati senza la divulgazione dei risultati ai colleghi. Tale comunicazione può avvenire sotto diverse forme, ma in genere sotto forma di pubblicazioni accademiche convalidate dalla peer-review. Il corso illustrerà il processo editoriale, l'evoluzione dell'attuale paradigma editoriale, i modelli editoriali emergenti e il lato oscuro della pubblicazioni.
Gender Medicine - Dr. Cinthia Farina and Prof. Alaide Chieffo
Nel corso della storia, la medicina e la biologia sono state sviluppate utilizzando un approccio androcentrico, generalizzando i risultati ai soggetti di sesso femminile e limitando le differenze di genere legate esclusivamente alle questioni di riproduzione. Il corso "Gender Medicine" presenterà un'introduzione alla medicina di nuova generazione, spiegherà le definizioni, evidenzierà i riferimenti normativi e le risorse e discuterà esempi e implicazioni per la ricerca e i servizi sanitari.
Writing Successful Fellowship Applications - Dr. Thiago Carvalho and Dr. David del Álamo (Fellowsherpa)
Per molti ricercatori all'inizio della carriera, scrivere una domanda di borsa di studio sarà la prima esperienza con il sistema di finanziamento scientifico altamente competitivo. Il corso interattivo di due giorni di Fellowsherpa espone ai partecipanti alcune delle più prestigiose borse di studio internazionali, tra cui i programmi post-dottorato Marie Skłodowska-Curie, EMBO e Human Frontier Science Program.
The european research framework: policy, funding programmes and research management - Dr. Federica Prete – Dr. Maya Fedeli
Il corso mira a comprendere il percorso che porta dall'argomento di un bando, passando per lo sviluppo di un'idea progettuale, fino alla stesura di una proposta alla sua presentazione nell'ambito di Horizon Europe e a fornire conoscenze e strumenti per lo sviluppo di progetti di ricerca europei. Inoltre, il corso presenterà le caratteristiche principali di Horizon Europe e i programmi ERC e Marie Curie. Infine, il corso introdurrà la Citizen Science e come integrare questo approccio innovativo nei progetti di ricerca.
Statistical methods in biomedical research - Prof. Paola Rancoita and Prof. Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti di base e avanzati per la raccolta, l'organizzazione e l'analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è suddiviso in due moduli:
MODULO 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULO 2: Creare modelli delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli è organizzata per competenze e non per anno di iscrizione
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
The course covers practical topics in coding with R. The aim of the course is to show how R coding can be used to solve common issues encountered by neuroscientists. The course will provide a basic introduction to R, covering data management, statistical modelling and data visualization. Elements of scripting will be introduced.
The course will have a practical and interactive layout, with learning achieved mainly through presentation of real-life problems and solutions via hands-on activities.
Business Planning - Dr. Giancarlo Monza
La ricerca e sviluppo (R&S) di oggi è la pratica medica di domani. Purtroppo, la sostenibilità della R&S è a rischio. Altri settori altamente innovativi (ad esempio l'industria aerospaziale, l'IT e anche... l'esercito) hanno cercato di affrontare il problema della sostenibilità migliorando le loro capacità di pianificazione/esecuzione dei progetti e la loro attenzione ai fattori umani.
Durante le lezioni verranno esaminate le tecniche di base della pianificazione dei progetti e delle prestazioni dei team (=persone) per minimizzare/prevenire gli errori umani, concentrandosi sulla peculiarità della R&S in ambito sanitario, dove l'etica e l'approccio incentrato sul paziente sono fondamentali. Verranno presentati esempi pratici di progetti falliti e completati con successo nel settore sanitario.
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Fundamentals of AI in medicine - Prof. Carlo Tacchetti
L'intelligenza artificiale (IA) sta guadagnando sempre più popolarità nel settore sanitario. Le tecnologie che consentono l'automazione di compiti clinici che richiedono tempo o i sistemi di supporto alle decisioni cliniche basati sull'apprendimento automatico, una branca dell'IA, potenzialmente miglioreranno le cure oncologiche. Tuttavia, l'uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati al di fuori dell'ambito clinico, senza coinvolgere gli operatori sanitari, ridurrà l'impatto clinico, creando sfiducia nell'IA. Presenteremo ai giovani ricercatori clinici le basi dell'IA, compresa una panoramica sui principali algoritmi di ML e le loro applicazioni con i dati sanitari, la progettazione di studi clinici che prevedono lo sviluppo di algoritmi di IA e le questioni etiche e di privacy legate all'uso di algoritmi di IA in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.
Follow-up on data management plan (DMP) and IRIS - Dr. Silvia Corbetta and Dr. Marco Soriano
Il corso mira a fornire un feedback sui DMP presentati dagli e dalle studenti e a discutere gli aspetti meno chiari identificati durante il processo di revisione. Il corso offre, inoltre, l'opportunità di chiarire eventuali dubbi sugli argomenti trattati nei DMP sottomessi e fornisce chiarimenti sulle caratteristiche di IRIS, l’archivio istituzionale di UniSR per la gestione delle pubblicazioni e degli altri output scientifici.
Courses curriculum-specific:
Targeting RNA-binding proteins in neuronal degeneration and repair (NEN)
Le proteine che legano l'RNA (RBP) svolgono ruoli essenziali nello sviluppo, nella funzione e nel mantenimento dei neuroni, controllando con precisione tutti gli aspetti della regolazione dell'mRNA, tra cui lo splicing alternativo, la stabilità, il traffico e la traduzione. È ormai chiaro che diversi disturbi neurologici sono legati a erronee funzioni e localizzazione delle RBP, e il bersaglio di questo gruppo di proteine potrebbe rappresentare un'interessante strategia terapeutica per prevenire la perdita neuronale e/o promuovere la riparazione neuronale. Questo corso fornirà una panoramica dei più recenti progressi nelle funzioni delle RBP nella riparazione neurale dopo una lesione, nonché le ultime evidenze che dimostrano come il targeting delle RBP possa rappresentare una nuova ed efficace via per il trattamento dei disturbi neurodegenerativi.
Pluripotent stem cells and next generation therapies (GCT)
L'avvento delle cellule staminali pluripotenti ha rivoluzionato il panorama della medicina rigenerativa. Intraprenderemo questo viaggio trasformativo con il nostro corso di dottorato all'avanguardia incentrato su cellule staminali pluripotenti e terapie di nuova generazione. Approfondiremo come le cellule staminali pluripotenti possano essere sfruttate per progettare e testare nuovi approcci terapeutici, esplorando la loro capacità unica di differenziarsi in diversi tipi di cellule. Il programma coprirà gli ultimi progressi nella ricerca sulle cellule staminali, tra cui l'editing del genoma basato su CRISPR e gli approcci di biologia sintetica, e porrà l'accento sulla traduzione delle intuizioni scientifiche in terapie innovative, promuovendo un profondo apprezzamento per le dimensioni etiche e normative delle applicazioni delle cellule staminali.
Molecular mechanisms of drug resistance in cells (CMB and BAIO)
In questo corso, gli studenti acquisiranno una migliore comprensione dei processi molecolari che le cellule mettono in atto per adattarsi alle terapie ed eludere la morte. In dettaglio, il corso sarà suddiviso in tre sessioni per avere una panoramica su i) metodi quantitativi innovativi per valutare la resistenza ai farmaci; ii) epidemiologia ed evoluzione dei meccanismi di resistenza nei microrganismi e iii) meccanismi di resistenza acquisita alla terapia mirata e all'immunoterapia. Oltre a conoscere i meccanismi molecolari di resistenza ai farmaci nelle cellule da parte di esperti del settore, gli studenti avranno l'opportunità di discutere ulteriormente con i relatori su questi argomenti preparando una lezione frontale e di esplorare le opzioni di carriera da intraprendere dopo il completamento dei loro studi di dottorato.
Biomarkers for precision medicine (ECM)
How to review scientific papers - Embo Solutions
In questo workshop, i redattori di EMBO lavorano con i e le studenti di dottorato sui principi e le pratiche della peer review. Gli argomenti trattati comprendono gli elementi chiave di una buona peer review e il ruolo della peer review nella pubblicazione di una scienza che sia riproducibile. Si discutono anche considerazioni etiche, come i conflitti di interesse, e si forniscono linee guida ai giovani scienziati su come diventare bravi revisori. Il corso prevede una combinazione di presentazioni teoriche, lavori di gruppo e discussioni interattive per coinvolgere i partecipanti.
Research Integrity (parte III) - Dr. Roberto Buccione
I ricercatori hanno la responsabilità generale di partecipare alle attività di comunicazione della scienza e di divulgazione, perché solo così facendo possono rendere accessibili i risultati delle proprie ricerche a un pubblico di non esperti, che potrebbe beneficiare di queste informazioni. Tali attività rientrano nello spirito della Responsible Research and Innovation (RRI). Il corso mostrerà l'importanza della comunicazione della scienza nella carriera di uno scienziato e svilupperà le competenze di comunicazione degli e delle studenti di dottorato, consentendo loro di trasmettere in modo chiaro, coinvolgente e accessibile i complessi concetti scientifici tipici dell’attività di ricerca a un pubblico più ampio. Durante il corso, gli e le studenti acquisiranno una comprensione delle strategie di comunicazione della scienza, impareranno a tradurre il linguaggio tecnico in un formato comprensibile per il pubblico generale e affineranno le loro abilità nell'utilizzo di diverse piattaforme e strumenti di comunicazione.
Open Science in practice: principles and tools for open access to scientific publications and research data - Dr. Silvia Corbetta - Dr. Marco Soriano
L'approccio Open Science (anche noto come “Scienza Aperta”) include tutte le pratiche che promuovono l'accessibilità e la trasparenza durante l’intero ciclo di vita di un progetto di ricerca. Il corso introduce i concetti chiave e i principi fondamentali dell'Open Science (come l’Accesso Aperto e la condivisione dei dati) e fornisce le linee guida e gli strumenti su come rendere ad accesso aperto le pubblicazioni e i dati, per garantire la riproducibilità e l'utilità sociale della ricerca scientifica. Inoltre, il corso fornisce le principali nozioni in merito al corretto utilizzo sia dell’archivio istituzionale per la gestione delle pubblicazioni (IRIS) che dell’archivio per il deposito e la condivisione dei dati (ORDR).
Statistical methods in biomedical research - Prof. Paola Rancoita and Prof Chiara Brombin
Il corso fornisce concetti di base e avanzati per la raccolta, l'organizzazione e l'analisi statistica dei dati nelle scienze biomediche. Il corso è suddiviso in due moduli:
MODULO 1: Statistica inferenziale: confronto tra gruppi e analisi bivariata.
MODULO 2: Creare modelli delle relazioni tra variabili.
La partecipazione ai moduli è organizzata per competenze e non per anno di iscrizione
Statistical methods in R - Dr. Arianna Sala
Il corso tratta argomenti pratici di programmazione con R. L'obiettivo del corso è mostrare come la programmazione in R possa essere utilizzata per risolvere problemi comuni incontrati dai neuroscienziati. Il corso fornirà un'introduzione di base a R, includendo la gestione dei dati, l'analisi statistica e la visualizzazione dei dati. Verranno introdotti elementi di scripting. Il corso comprenderà una struttura pratica e interattiva, con un apprendimento ottenuto principalmente attraverso la presentazione di problemi e soluzioni reali tramite attività pratiche.
Project Assessment - Dr. Gianni Navalesi
E cosa succede se il mio progetto scientifico/clinico non va bene? Dobbiamo trovare un'altra opportunità o dobbiamo buttare nel cestino quello che abbiamo fatto? Ci concentreremo sulla valutazione dell'importanza di avere a disposizione tecniche di approccio basato sul rischio, pianificazione del rischio e misure di minimizzazione del rischio. Questi strumenti mirano a mitigare eventuali scostamenti indesiderati dall'obiettivo scientifico.
A questo proposito, verrà sottolineata l'importanza di avere in mente altre potenziali soluzioni nel caso in cui l'obiettivo primario non possa essere raggiunto. Verranno illustrati alcuni esempi di farmaci che sono stati riproposti da un'indicazione clinica a un'altra (ad esempio, il Sildenafil), nonché l'opportunità di passare ad altri settori come i dispositivi medici o gli integratori alimentari.
Fundamentals of AI in medicine - Prof. Carlo Tacchetti
L'intelligenza artificiale (IA) sta guadagnando sempre più popolarità nel settore sanitario. Le tecnologie che consentono l'automazione di compiti clinici che richiedono tempo o i sistemi di supporto alle decisioni cliniche basati sull'apprendimento automatico, una branca dell'IA, potenzialmente miglioreranno le cure oncologiche. Tuttavia, l'uso inconsapevole di tali algoritmi, spesso sviluppati al di fuori dell'ambito clinico, senza coinvolgere gli operatori sanitari, ridurrà l'impatto clinico, creando sfiducia nell'IA. Presenteremo ai giovani ricercatori clinici le basi dell'IA, compresa una panoramica sui principali algoritmi di ML e le loro applicazioni con i dati sanitari, la progettazione di studi clinici che prevedono lo sviluppo di algoritmi di IA e le questioni etiche e di privacy legate all'uso di algoritmi di IA in ospedale.
PhD inter disciplinary seminars
Oggi più che mai, la ricerca scientifica è un'impresa complessa che richiede ampie conoscenze al di fuori del contesto specifico per produrre risultati d'impatto e aiutare i ricercatori a crescere in un ambiente altamente competitivo.
Questo corso è stato creato su iniziativa del Prorettore per la ricerca scientifica e degli studenti insieme al Research Policy Office (RPO) per discutere temi interdisciplinari, dall'impatto sociale della scienza alla gestione dei carichi di lavoro ad alta pressione.
L'obiettivo è stimolare un pensiero critico e fuori dagli schemi. Il corso prevede 3 seminari tenuti da esperti esterni, selezionati da un comitato di dottorandi dei 3 corsi, coordinati da Monica Fabbri (RPO).
PhD students-invited lectures
Le PhD student-invited lectures sono seminari organizzati da un comitato di dottorandi, composto da studenti provenienti da diverse aree di ricerca. Il Comitato seleziona e invita ogni anno 3-4 scienziati internazionali. Gli scienziati invitati tengono conferenze aperte a tutti i membri dell'istituto e dedicano poi tempo a discutere con i dottorandi sia delle loro ricerche sia di argomenti più generali, come il percorso per diventare un ricercatore indipendente, ecc. I seminari offrono agli studenti l'opportunità di interagire con scienziati di alto livello in un ambiente informale e di migliorare le capacità di networking, fondamentali nella ricerca scientifica.
Career opportunities seminar series
La serie di seminari "Career Opportunities Seminar Series" mira a promuovere le prospettive di carriera e le opportunità professionali per i dottorandi nei campi della ricerca e nei settori correlati, sia pubblici che privati. L'ampia varietà di potenziali percorsi di carriera a cui i dottorandi possono aspirare richiede una comprensione delle opportunità disponibili.
Per promuovere questa comprensione e creare contatti utili con il mondo del lavoro, vengono organizzati vari seminari tenuti da professionisti di spicco in diversi campi di interesse, provenienti sia da ambienti accademici che aziendali. I seminari comprendono una breve panoramica del percorso professionale del relatore che ha portato alla sua attuale posizione, una descrizione delle sue attività e, infine, una fase di colloqui individuali o di gruppo con i dottorandi.